基因组物理图谱,遗传图谱有什么区别,有何用途?
什么是基因的遗传图谱 物理图谱,两者有何区别 遗传图谱:某一物种的染色体图谱(也就是我们所知的连锁图谱),显示所知的基因和/或遗传标记的相对位置,而不是在每条染色体上特殊的物理位置。采用遗传学分析方法将基因或其它DNA标记按一定的顺序排列在染色体上,这一方法包括杂交实验,家系分析。标记间的距离(遗传图距)用减数分裂中的交换频率来表示,单位为厘摩Centi-Morgan,cM),每单位厘摩定义为1%交换率。遗传学图谱的解像度(分辨率)低,大约只能达到100万碱基对(1Mb)的水平。物理图谱:顾名思义,是DNA中一些可识别的界标(如限制性酶切位点、基因等)在DNA上的物理位置,图距是物理长度单位,如染色体的带区、核苷酸对的数量等两者异同:①遗传图谱是基于重组频率,物理图谱是基于直接测量的DNA结构。②减数分裂重组的频率并不统一沿大多数染色体。有一些热点和冷点在重组和或突变。热点和冷点会导致相当大的格律失真时,遗传图谱和物理地图并排排列时。③遗传图谱表示的是基因或标记间的相对距离,以重组值表示,单位CM④物理图谱表示的是基因或标记间的物理距离,距离的单位为长度单位,如μm或者碱基对数(bp或kp)等。简而言之前者是描述的基因相对位置,后者是具体的碱基位置二者存在的意义。
遗传图谱和物理图谱的区别 前者是描述的2113基因相对5261位置,后者是具体的4102碱基位置遗传图谱是某一1653物种的染色体图版谱(也就是我们所知权的连锁图谱),显示所知的基因和/或遗传标记的相对位置,而不是在每条染色体上特殊的物理位置。由遗传重组测验结果推算出来的、在一条染色体上可以发生的突变座位的直线排列(基因位点的排列)图。物理图谱是利用限制性内切酶将染色体切成片段,再根据重叠序列确定片段间连接顺序,以及遗传标志之间物理距离[碱基对(bp)或千碱基(kb)或兆碱基(Mb)]的图谱。以人类基因组物理图谱为例,它包括两层含义,一是获得分布于整个基因组30000个序列标志位点(STS,其定义是染色体定位明确且可用PCR扩增的单拷贝序列)