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基因组中重复序列的意义 分析基因组重复序列

2021-04-09知识12

人的基因各不相同,那为什么还要测人类基因组序列呢? 人类基因组DNA序列分布于22条常染色体和2条性染色体上,目前人们已掌握其信息储存与表达规律的基因,只占其中的一小部分。对人类基因组的研究,并不是为了单纯地积累数据,。

基因组重复序列的特点 最低0.27元开通文库会员,查看完整内容>;原发布者:kjxyzxh知识介绍《生命的化学》2008年28卷3期CHEMISTRY OF LIFE 2008,28(3)·343·文章编号:1000-1336(2008)03-0343-03 基因组中重复序列的意义艾对元(兰州大学化学系功能有机分子化学国家重点实验室,兰州 730000)摘要:从原核生物到真核生物,其基因组中的重复序列呈递增趋势。重复序列的作用也被各种实验所揭示。各种重复序列的类型与它在e799bee5baa6e997aee7ad94e78988e69d8331333433623763染色体上的分布密切相关。重复序列不是垃圾,而是影响着生命的进化、遗传、变异;同时它对基因表达、转录调控、染色体的构建以及生理代谢都起着不可或缺的作用。它们的功能及演化也正在被逐步阐明。关键词:重复序列;基因组;基因调控网络中图分类号:Q75随着许多生物基因组测序工作的完成,大量的重复序列(repetitive sequence)被发现。重复序列在病毒和原核生物中很少出现;在真核生物中重复序列则广泛分布。它不仅在顺式调控元件如启动子、增强子、终止子处被大量发现,而且,很多rRNA基因和组蛋白基因本身就呈重复排列,称为基因簇。更为重要的是,它能够促使核酸形成高级结构,最终分化为常染色质(euchromatin。

SSR分子标记的原理 简单重复序列(Simple Sequence Repeat,SSR)简单重复序(SSR)也称微卫星DNA,其串联重复的核心序列为1一6 bp,其中最常见是双核苷酸重复,即(CA)n和(TG)n每个微卫星DNA的核心序列结构相同,重复单位数目10一60个,其高度多态性主要来源于串联数目的不同。SSR标记的基本原理:根据微卫星序列两端互补序列设计引物,通过PCR反应扩增微卫星片段,由于核心序列串联重复数目不同,因而能够用PCR的方法扩增出不同长度的PCR产物,将扩增产物进行凝胶电泳,根据分离片段的大小决定基因型并计算等位基因频率。在真核生物中,存在许多2-5bp简单重复序列,称为“微卫星DNA”其两端的序列高度保守,可设计双引物进行PCR扩增,揭示其多态性。SSR具有以下一些优点:(l)一般检测到的是一个单一的多等位基因位点;(2)微卫星呈共显性遗传,故可鉴别杂合子和纯合子;(3)所需DNA量少。显然,在采用SSR技术分析微卫星DNA多态性时必须知道重复序列两端的DNA序列的信息。如不能直接从DNA数据库查寻则首先必须对其进行测序。SSR的分类 根据SSR核心序列排列方式的不同,可分为3种类型:完全型(perfect)。指核心序列以不间断的重复方式首尾相连构成的DNA。如:。

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