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怎么证明一个蛋白具有载脂功能?已知它在本身生物体内是载脂蛋白,怎么证明它在其它生物体内相同功能 如何根据已知模型预测蛋白功能

2020-07-26知识4

如下哪个生物信息学方法可以用来寻找新基因 生物信息学方法可以用来寻找新基因.1,序列比对(Sequence Alignment)序列比对的基本问题是比较两个或两个以上符号序列的相似性或不相似性.从生物学的初衷来看,这一问题包含了以下几个意义:从相互重叠的序列片断中重构DNA的完整序列.在各种试验条件下从探测数据(probe data)中决定物理和基因图存贮,遍历和比较数据库中的DNA序列比较两个或多个序列的相似性在数据库中搜索相关序列和子序列寻找核苷酸(nucleotides)的连续产生模式找出蛋白质和DNA序列中的信息成分序列比对考虑了DNA序列的生物学特性,如序列局部发生的插入,删除(前两种简称为indel)和替代,序列的目标函数获得序列之间突变集最小距离加权和或最大相似性和,对齐的方法包括全局对齐,局部对齐,代沟惩罚等.两个序列比对常采用动态规划算法,这种算法在序列长度较小时适用,然而对于海量基因序列(如人的DNA序列高达109bp),这一方法就不太适用,甚至采用算法复杂性为线性的也难以奏效.因此,启发式方法的引入势在必然,著名的BALST和FASTA算法及相应的改进方法均是从此前提出发的.2,蛋白质结构比对和预测基本问题是比较两个或两个以上蛋白质分子空间结构的相似性或不相似性.蛋白质的结构与功能是密切相关的,一般认为,具有。如何从氨基酸顺序预测蛋白质功能? https://www. sciencephoto.com/media/ 639617/view事实上,扭转角 ? 和 ψ 并不是在360°范围内随机均匀分布的,1963年就有科学家统计过扭转角 ? 和 ψ 的分布,他们发现。为什么从蛋白质的一级结构准确预测其三维结构那么难? 因为热力学第二定律,氢键,疏水作用这些因素太难用相应的算法加以刻画吗?还是说顺序执行的算法在速度上…

#科学#基因合成#序列模式#科普#相似性

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