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如何下载基因组参考文件 基因组下载新方法:Ensembl

2021-03-09知识3

生物信息学一些基本的常用软件有哪些?。RNApromo Computational prediction of RNA structural motifs involved in post transcriptional regulatory processes 。。

分子生物学实验中有哪些常用的软件? SnapGene http://www. snapgene.com/ 遇见SnapGene之前大概使用过十几种分子克隆软件,直到有一天遇到了SnapGene,发现它差不多集成了之前十几种软件的优点,同时摒弃了它们。。

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想入生物信息学这个行业,python学习要达到什么程度??? 生物背景,想入生物信息这个行业,于是自学python?请问要学到什么程度?还有R语言,要到什么程度可以入…

有哪些好的科研工具软件? 官网:https://www. mendeley.com/? interaction_required=true 这是一个PDF管理和参考工具,免费下载和使用。其实它的工作原理有点像Dropbox,可以把它安装在不止一个设备上。

人类基因组重测序数据有哪些分析步骤?每个步骤的目的是什么? 也是从那时开始和大家一起参与或者主导了很多前沿而重大的人群基因组项目,在组学领域也有一些收获(https://www. researchgate.net/profil e/Shujia_Huang/contributions)。

谁使用过wu-blast Bioedit提供了本地blast工具(菜单里的local blast 功能),如图一。你需要把基因组数据做成本地数据库,使用菜单里的create a local nucleotide database file功能建立本地DNA数据库,建库的原始数据需要做成fasta格式的,建成的数据库存放在\\bioedit\\database文件夹里。然后用另一种菌的基因序列和基因组本地数据库做blastn或者tblastx(图二),就能找到与这个基因序列相似性较高的contig了。我的bioedit版本较低,估计也能参考吧。也可以直接从NCBI下载本地blast相关程序,使用dos命令行操作。

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