三国时期，诸葛亮发动了第一次北伐，起初非常顺利，到了后面当时的大将魏延提出了一条建议便是从当时的一个叫子午谷的地方带五千精锐抄小路偷袭长安用最低的成本赚取最大的回报。谨慎的诸葛亮将其拒绝了，后人对子午谷奇谋的可行性也是议论纷纷，有人说诸葛亮太谨慎，有人说如果实行定可一战定中原。其实在一千多年后的明朝末年有人便用性命对子午谷奇谋的可行性给出了答案，这便是明末第一任闯王高迎祥。
后来的闯王李自成此时是时任闯王高迎祥的手下的闯将,崇祯九年(1636)，闯王高迎祥也想绕道汉中穿过子午谷，一举拿下西安占领陕西。高迎祥是陕西人，估计对于这条子午谷非常熟悉，他以为别人肯定不会想到他会从这里通过。也正是因为他知道诸葛亮曾经否定过子午谷奇谋,所以他觉得反其道而行之正常人就不会察觉。子午谷是一条小路，非常狭窄，周围两边全是高山。当时又是七月天气，天降大雨，道路难走。几百里的山路，高迎祥的五万大军走了十多天，终于到达黑水峪，只要通过这里，前方就是一马平川。
孙传庭但是，高迎祥万万没想到的是，一个叫孙传庭的人算准了农民军会走这条路，已经在这里埋伏了半个月，两万多秦兵养精蓄锐，只等一战。而这位孙传庭就是高迎祥的克星，这支军队经过短暂的训练，开赴战场，却展现了强大的战斗力，成为明末与关宁铁骑等齐名的精锐部队。而且孙传庭下决心稳定陕西局势，恢复生产。而当此时，高迎祥企图通过三国时期的子午谷，偷袭西安，出其不意占据陕西。
当他亲率大军走子午谷小道，走了15天，当精疲力尽走到子午谷口的时候，却被孙传庭的2万军队的埋伏。最后经过4个昼夜的激战，高迎祥军队全军覆没，而高迎祥被俘虏。直接被押送到京城，崇祯为了报仇雪恨，直接下令，将高迎祥直接凌迟处死，而且凌迟的刀数，达到1560刀，死的极其凄惨。闯王这个头衔，从此归他外甥李自成所有，并被李自成发扬光大。
孙传庭是一个牛人，此次子午谷大战消灭了闯王高迎祥的势力，堪称明朝末年对农民军作战战果最辉煌的一次战斗。而崇祯如果能够信任孙传庭的话，估计明朝不会突然被李自成大军灭亡。
李自成此战使得李自成、张献忠等仅仅带少数起义军逃入深山，而正在孙传庭企图将其一网打尽的时候，崇祯却突然下令，让孙传庭火速增援京师，使得给了李自成、张献忠喘息之机，李自成逃出山里，收拢部众，再次死灰复燃，最后在1644年攻入北京，崇祯皇帝上吊自杀。
而此战也告诉所有人，“子午谷奇谋”虽然是好计策，却很难成功。
