推荐几个模拟构建蛋白质结构的软件？ pymol有拉氏构象图

请教蛋白质相互作用or受体配体作用 Pymol 是一个结构显示和分析程序.它是用python编写的所以叫pymol，相应的还有Jmol 等。Pymol 的好处是做出来的图很炫。很多牛人用它做图发文章，蛋白质结构预测里面现在。如何用pymol做动画 需要准备的工作：找到合适的目标蛋白：具有两个不同的构像结构的蛋白，序列最好相同 Google下载morph_dist.inp这个文件 下载安装Yale University提供的Crystallography&NMR System这个软件[2]，建议在linux系统里安装 下载安装pymol软件[3]Window movie maker 或者其他任何可以利用图片生成动画的软件具体操作：用pymol将两个蛋白align在一起保存（右边控制栏Aalignto molecule-），align之后保存文件（save molecule as）将morph_dist.inp这个文件保存到与两个蛋白pdb文件相同的路径下，用文本编辑器打开，将其中的initial pdb和final pdb改成自己的两个pdb文件名。即分别为初始状态和最终状态。例如，自己保存的两个蛋白为A.pdb和B.pdb，则改成：initial=\"A.pdb；final=\"B.pdb；3.在安装有CNS软件的linux机器上打开terminal，进入到文件保存的路径（cd 命令进入路径），输入cns，回车 4.输入@morph_dist.inp 命令，软件就会自己开始计算中间态pdb了，默认生成的是20个pdb。名字为frame*.pdb 5.运行结束后输入以下几行命令：mv frame0.pdb frame00.pdb mv frame1.pdb frame01.pdb mv frame2.pdb frame02.pdb mv frame3.pdb frame03.pdb mv frame4.pdb frame04.pdb mv 。推荐几个模拟构建蛋白质结构的软件？ 你是说做出一个蛋白质结构模型呢 还是说看蛋白质的空间结构的软件的呢 都说了吧：由一条序列做出一个蛋白质结构模型最常用的方法是同源模建，软件有modeller（比较专业）swiss-pdb-viewer（本地提交在线预测结构的）看蛋白质空间结构图的软件有：pymol，rasmol，vmd 还有上面这个swiss-pdb-viewer 也可以看。

#蛋白质结构#pymol#pdb#质子化