很多用户在小程序没有上线之前，由于饱受APP占用内存方面的痛苦，对小程序充满着期待，但在小程序上线没几天，很多人纷纷吐槽小程序的用户体验，小程序作为一个轻量级的应用，尽可能的轻便致使它的内存比较小，在这个限制之下，用户得到的体验也就受一些限制。
小程序在之前被称为简化版的APP，原因就在于小程序只拥有APP的部分功能。微信对小程序内存大小的限制使它只能保留核心功能，对于一些相对复杂的功能，小程序则无法支持。
比如，腾讯视频小程序只能支持在线观看，不能对视频进行上传或者下载；小程序今日头条只能按照固定的方式推送内容，没有办法进行评论分享等功能，之前所具备的特色功能不能体现出来；滴滴打车小程序只能叫快车，不能叫专车、出租车等。
小程序为了追求极简，把APP中的许多功能进行了删减，一些用户常见的功能都消失了，用户得到的体验也被大打折扣。这对于那些用户不经常使用的APP可能影响不大，但是对于那些用户经常使用的，需求比较多的，小程序就远远不能满足需求了，只能继续使用APP。
对于移动用户来说，流量问题是自己非常关心的问题，使用APP时如果没有无线网络往往会注意流量的问题。小程序作为一款轻量级的应用，在内存占用方面比较省心，按理说应该节省流量，但是有些用户表示，部分小程序其实比APP还要费流量。
有人用猎豹清理大师对此进行了测验，结果发现部分同款小程序在加载时消耗的流量比APP还要多。以市面上普及度比较高的主流应用为样本进行对比，发现其中有一半的APP在第一次加载中耗费的流量比小程序多，有三分之一的APP在两次加载时消耗的流量比小程序少。
比如，摩拜单车这款APP，在第一次加载时只有0.22MB流量，在第二次加载时仅消耗了0.06MB。但是对于这款小程序来说，第一次加载用了1MB，第二次加载则使用了0.7MB。当然也有一些小程序在两次加载时消耗的流量均小于APP，用户如果只是抱着节省流量的心态去下载小程序，还是需要进一步的比较才行。
小程序还有一个经常被用户吐槽的地方是小程序的入口问题。小程序不会主动出现在用户手机里，要想找到小程序的入口，一个前提是把微信更新到最新版本，然后在内部进行搜索或者是扫描。对于很多用户来说，可能对于小程序了解没那么多，不知道小程序的入口方式自然找不到小程序。而那些知道小程序入口方式的用户，也有可能忽略了最新版本这个前提，因此也不能找到小程序。
小程序没有集中入口的原因一方面在于不打扰用户；可在另一方面也给用户增添了一些烦恼，尤其是在前期小程序不支持模糊搜索，用户只能搜索小程序的全称才能找到小程序，这都给用户增加了困难，在体验上自然不会太好。
对于任何事来说，都存在利弊两种情况，一方面，小程序追求极简虽然能够给用户带来一定的便利；但是另一方面，也会使用户的体验减去很多，用户其实应该看到这利弊这两个方面，对于那些经常使用的APP可以继续保留在手机里，对于那些不经常使用的，需求比较少的APP，换成小程序的形式未必不是一件好事。
