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《自然》重磅发现癌基因存在于环形染色体外脱氧核糖核酸(ecDNA)能否带来癌症治疗领域的第四次革命? 扩增子数据分析参考书

2020-10-11知识5

如何自学生物信息学? 期间做过很多大型的人类基因组学项目(https://www.researchgate.net/profile/Shujia_Huang/contributions),因此在这里我想结合自己的体会回答一下这个问题。什么是生物。

《自然》重磅发现癌基因存在于环形染色体外脱氧核糖核酸(ecDNA)能否带来癌症治疗领域的第四次革命? 扩增子数据分析参考书

Nature 重磅发现癌基因存在于环形 ecDNA,是否会带来癌症治疗领域的第四次革命? 论文第一作者是知乎生物学优秀回答者@吴思涵,膜拜大佬论文原文:Circular ecDNA promotes accessible c…

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Nature 重磅发现癌基因存在于环形 ecDNA,是否会带来癌症治疗领域的第四次革命? 泻药~首先来讲一下,这篇论文的创新性在哪里?1、有人质疑说,ecDNA不早就发现了吗?也有人讲是环状的啊~…

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本科生物,研究生转生信。如何自学编程呢,请问哪里有开放生信源码,可供自己借鉴呢?

如何设计荧光定量PCR的引物及TaqMan探针 (转载,仅供参考)a)针对双标记探针的引物和探针设计的规则所选序列应该高度特异。应该选择具有最小二级结构的扩增子。这是很重要的,因为二级结构会影响反应效率。在任何实时应用中期望获得100%的扩增反应效率,这意味着每次循环中,体系内的扩增子都有两倍的增加。如果二级结构在热力学上比寡聚目的基因更稳定,那目的基因的杂交将会失败。二级结构还会阻碍酶的扩增。如果扩增子的二级结构不能避免,则引物的退火温度要相应提高。在整个过程中,我们要进行BLAST和类似的分析,以确保特异性。通用原则1,先选择好探针,然后设计引物使其尽可能的靠近于探针。2,扩增子的长度应不超过400bp,理想的最好能在100-150bp内,扩增片断约短,有效的扩增反应就越容易获得。较短的扩增片断也容易保证分析的一致性3,保持GC含量在20%和80%之间,GC富含区容易产生非特异反应,从而会导致扩增效率的降低,及在SG分析中非特异信号。4,为了保证效率和重复性,应避免重复的核苷酸序列,尤其是G(不能有4个连续的G)5,将引物和探针互相进行配对检测,以避免二聚体和发卡结构的形成。b),探针设计指导1,在设计引物之前设计探针2,探针的Tm值应在68-70℃之间,如果是。

本科生物,研究生转生信。如何自学编程呢,请问哪里有开放生信源码,可供自己借鉴呢? 我的生信博客 http://blog.genesino.com 151 人赞同了该回答 作为本科学生物,后来转行生物信息的人,经常会被人问起,为啥学习生物信息了呢?这背后通常会带着一些困惑,。

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