对于一段有重复序列的片段如何扩增,只是一个基因的中间的部分序列,准备扩增做overlap。 1.如果是非特异性扩增引起的无法扩增目的条带,那么可以提高退火温度,或者换酶,或者先切胶回收较浅的目的条带,再次扩增2.如果退火温度太高,可以用两步法扩增3.如果引物GC值太高,可以加DMSO
DNA重复序列 你说的两种情况都是有的。我们遗传学课本上的定义是:重复序列是指在基因组中重复出现的DNA序列,根据其在基因组中重复频率特点又可分为串联重复序列和分散重复序列。
如何找出序列中短重复片段并标注 基因组中由寡核苷酸串联,重复排列的DNA序列,构成数量可变的串联重复序列,其中,微卫星DNA又称为短串联重复片列,是一种可遗传的不稳定的且具有高度多态性的短核苷酸重复序列,具有种类多,分布广,高度多态性等特点,这种多态性标志已广泛用于遗传病及亲子鉴定等.短序列比对中,一般常用的算法主要有三个:(1)空位种子片段索引法,如MAQ、ELAND等,首先将读段切分,并选取其中一段或几段作为种子建立搜索索引,再通过查找索引、延展匹配来实现读段定位,通过轮换种子考虑允许出现错配(mismatch)的各种可能的位置组合;(2)Burrows Wheeler转换法,如Bowtie、BWA、SOAP2等,通过B-W转换将基因组序列按一定规则压缩并建立索引,再通过查找和回溯来定位读段,在查找时可通过碱基替代来实现允许的错配;(3)Smith-Waterman动态规划算法,如BFAST,SHRiMP等,利用初始条件和迭代关系式计算两个序列的所有可能的比对分值,并将结果存放于一个矩阵中,利用动态规划的方法回溯寻找最优的比对结果。
真核生物基因组中的dna重复序列主要有哪些类型 1.高度重复序列重复几百万次,一般是少于10个核苷酸残基组成的短片段。如异染色质上的卫星DNA。它们是不翻译的片zd段。2.中度重复序列重复次数为几十次到几千次。如rRNA基因、tRNA基因和某些蛋白质(如组蛋白、肌动蛋白、角回蛋白等)的基因。3.单一序列在整个基因组中只出现一次或少数几次的序列(也称为单拷贝序列或单拷贝基因),在小鼠中约占基因组的70%。如珠蛋白基因、卵清蛋白基因、丝心蛋白基因等。实验证明,所有真核生物染色体可能均含重复序列而原核生物一般只含单一序列。高度和中度重复序列的含量随答真核生物物种的不同而变化。
DNA鉴定用的是哪条染色体上的DNA? 您好。DNA鉴定中,所使用的短串联重复序列(STR)标记在23对46条染色体中都大量存在。而鉴定试剂盒生产商ABI和promega、中德美联等,都是采取13个核心位点和其他多态性比较。
多拷贝基因和大量重复序列不一样吗??有什么区别啊?!!急急急!!谢谢帮忙!!
根据以下资料回答问题:
单拷贝基因与不重复序列的区别? 单拷贝基因是不是不重复序列?单拷贝基因有什么作用 重复序列是重复序列,基因是基因。基因内部可以有重复序列,重复序列不可能是重复基因。重复序列短,重复基因看成因,。
已测序基因组的杂合度,重复序列水平怎么查询