公元1628年，马宝降生在陕西省的平凉府隆德，马宝在很小的时候就失去了父母，成人的后他身材长得很是魁梧，使得一把好鞣鞭枪，有勇有谋，当了盗贼，所向无敌，马宝虽然当了盗贼，但他很喜欢与当时社会上的士人和官吏结交朋友，这增长了他的见识和眼界，马宝有五个儿子，其中一个还诗集流行于世上，公元1629年，陕西的李自成率部众起义反抗行将破灭的明王朝，公元1643年，李自成的大军攻取了马宝的家乡隆德，马宝投靠到了李自成的麾下效力，马宝跟随李自成杀入大明帝国的都城北京城，其因战功而被升职，进入了北京城的李自成开始骄傲自满，他纵容手下残害明朝官员，逼反吴三桂，最终，李自成于公元1645年兵败被杀。
李自成去世后，马宝和农民起义军的一些将领去投靠了南方的南明政权。当时执掌南明政权大权的皇帝是桂王朱由榔，当时朱由榔是替前明王朝镇守广东部分地区，他闻知明朝被李自成灭亡后，其遂于公元1646年称帝（这便是南明历史上著名的永历帝），建立南明王朝，以作为明朝的延续，公元1647年，朱由榔命马宝率兵攻取广东其他地区，马宝统兵连克广东数城，公元1650年，马宝被永历帝任命为护驾大将军，永历帝被马宝由广东护送到广西地区，朱由榔迁到广西之后，清廷命平南王尚可喜夺取广州城，朱由榔命马宝率兵攻打广东的清远，以牵制清兵，从而解广州之围，但其被清兵击退，之后，广东大部分都落入清朝手中，马宝率领南明军转战在广西地区的山林之中。
公元1652年，不甘心失败的永历帝朱由榔再次命令马宝等将领攻打两广地区，马宝与李定国等人连下广东广西大部分地区，但第二年，马宝在广东省境内吃了败仗，他只好退守贵州，公元1656年，永历帝朱由榔退守云南。公元1657年，在贵州的南明将领孙可望背叛了朱由榔而自称皇帝，朱由榔派遣手下的得力干将李定国去讨伐孙可望，孙可望指派马宝等将领抄小路去袭击在云南昆明的朱由榔，但马宝临阵倒戈，在马宝和李定国等人的夹击之下，孙可望的叛乱被平定下去了，之后，清朝命吴三桂袭取两广和云贵地区。吴三桂统率大军猛攻南方数省之地，在吴军的猛烈攻势下，南明政权抵挡不住，两广和云贵地区都被吴三桂大军夺取，马宝无奈投降吴三桂，而永历帝朱由榔逃到了缅甸。吴三桂派兵将朱由榔抓回云南昆明处死，南明政权灭亡。
吴三桂看马宝骁勇善战，遂将他收为义子，并大加重用他，公元1664年，马宝帮助吴三桂平定了云贵和两广等地土著民族的叛乱，吴三桂对马宝大加赞赏！公元1673年，康熙皇帝打算对南方数省实行撤藩政策，这彻底激怒了功劳巨大的吴三桂。对清廷反意已久的吴三桂遂杀掉云南巡抚朱国治而举兵反清复明，他先前杀掉南明皇帝朱由榔，现在又打着复明的旗号，这让那些民间的反清复明势力没有积极的响应他，吴三桂加封马宝为铁骑总管将军，并奉其命令由云南去袭取贵州，马宝统率大军攻向贵州，贵州各地纷纷投降吴军，马宝又率领吴军去抢占湖南，没多久就夺取了湖南地区，并拒守湖南北方的门户岳州，以阻止长江以北湖北、河南等中原之地的清军渡江南下。
由于吴三桂没有调兵积极的北上中原，以夺取清朝的心脏地区而灭掉它，吴三桂和大清王朝的对垒战由速决战演变成了持久战，坐拥南方贫瘠之地的吴三桂势力本来就缺乏人力物力资源，他在清廷的多年对战中严重的消耗着自身的实力，而且也错失了呼应陕西、河北等省的反清力量的大好时机，公元1678年，吴三桂未完成灭清的大业就病死了，他的孙子吴世璠继承他的帝位，吴三桂死后，吴军军心开始涣散，清兵抓紧了对南方数省的围攻战，公元1679年，清兵终于渡江攻破了湖南北方的大门岳州，马宝南逃。清兵最终夺取了南方所有地区，并将吴世璠逼死在云南昆明，而马宝战败后只得隐遁在贵州一个叫岱港村的地方，公元1699年，马宝在岱港村去世。
