．基因工程需对基因进行分子水平操作，蛋白质工程不对基因进行操作 解析：基因工程，又叫基因拼接技术或 DNA 重组技术。是按照人们的意愿，把一种生物的某种基因取出来，加以修饰改造，然后放到另一种生物的细胞里，定向地改造生物的遗传性状。蛋白质工程是指已蛋白质分子的结构规律及其生物功能是关系作为基础，通过基因修饰或基因合成，对现有蛋白质进行改造，或制造一种新的蛋白质，一满足人类的生产和生活的需求。故选 B答案：B
为什么改造基因时，要对基因进行修饰或合成基因，因此，需要用到基因工程中的有关酶， 首先是为了使改造后的基因更容易达到改造者的要求，其次是为了是改造的这个过程更加容易，最后是为了使改造过后的基因更加容易表现。改造的时候要用到相关的酶来进行。
基因工程、代谢工程、合成生物学的异同 基因工程是指重组DNA技术的产业化设计与应用，包括上游技术和下游技术两大组成部分.上游技术指的是基因重组、克隆和表达的设计与构建（即重组DNA技术）；而下游技术则涉及到基因工程菌或细胞的大规模培养以及基因产物的分离纯化过程.以下为其发展：第一代基因工程 蛋白多肽基因的高效表达（经典基因工程）第二代基因工程 蛋白编码基因的定向诱变（蛋白质工程）第三代基因工程 代谢信息途径的修饰重构（代谢途径工程）第四代基因工程 全基因组或染色体的转移（基因组工程）代谢工程则是基因工程的延伸.即利用基因工程技术定向改造细胞的代谢途径，以改善产物的形成和细胞的性能.基因工程通常只涉及少量基因的改造，比如将编码某种蛋白药物的单一基因转入酵母，然后用该酵母发酵生产该药物.但是代谢工程会涉及大幅度的基因改变，比如为在大肠杆菌中生产某种代谢产物，比如紫杉醇（尚在研究阶段），必须把一系列相关途径的酶的基因全部导入大肠杆菌，并且敲除不必要和有害的大肠杆菌中原本就有的代谢通路，以构建出一整套大肠杆菌中原本没有的紫杉醇的代谢途径，使大肠杆菌能够生产紫杉醇.例如在酵母糖基人源化的改造中，共敲除了酵母的大约11个基因，然后导入大约5个人的糖基转移酶。
