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盈亏平衡分析法 shesis基因连锁不平衡分析

2021-04-28知识2

去文库,查看完整内容>;内容来自用户:令狐引刀基于SNP的连锁不平衡分析刘智广药物基因组学教研室主讲内容一、单核苷e5a48de588b63231313335323631343130323136353331333433646431酸多态性二、连锁不平衡分析三、单体型分析四、应用举例药物基因组学教研室一、单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphisms,SNPs)1.SNPs概念5SNPs指染色体DNA序列中的某个位点由于单个核苷酸的变化而引起的多态性,在群体中的频率>;1%。SNPSNPAACACGATCCGCCATGATATCAGTGACCGTAAACACGATTCGCCATGATATCAATGACCGTA药物基因组学教研室SNPs的基本类型5SNPs属于二等位基因,有两种基本类型:转换:嘧啶置换嘧啶C-T嘌呤置换嘌呤G-A颠换:嘧啶与嘌呤互换C-A(G-T)C-G(G-C)T-A(A-T)5转换:颠换=2:1药物基因组学教研室GpC岛SNPs发生率较高,约占总SNPs25%,主要是C-T。可能胞嘧啶是最易发生突变位点;且大多数是甲基化的,自发脱氨基形成胸腺嘧啶。2.SNPs的特点5数量多、分布广:一个个体至少携带300万SNPs,平均300-1000pb有一个SNPs。有学者推测基因组约有1000万个SNPs。5相对稳定:每一代中每个核苷酸变异频率极低(10-8),且这种变化的随机性。5易于快速筛查和基因分型:SNPs的二态性。

怎么根据连锁不平衡结果做单倍型分析 不

成本可分为二大块,一块称为固定成本,不因量的变化而增加.另一块称变动成本随量的变化而变化.盈亏平衡分析法就是在这基础上可知道只要达到多少量,可以保本不亏,超过多少量可。

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