基因组重复序列的特点 最低0.27元开通文库会员，查看完整内容>；原发布者：kjxyzxh知识介绍《生命的化学》2008年28卷3期CHEMISTRY OF LIFE 2008，28（3）·343·文章编号：1000－1336（2008）03－0343-03 基因组中重复序列的意义艾对元（兰州大学化学系功能有机分子化学国家重点实验室，兰州 730000）摘要：从原核生物到真核生物，其基因组中的重复序列呈递增趋势。重复序列的作用也被各种实验所揭示。各种重复序列的类型与它在e799bee5baa6e997aee7ad94e78988e69d8331333433623763染色体上的分布密切相关。重复序列不是垃圾，而是影响着生命的进化、遗传、变异；同时它对基因表达、转录调控、染色体的构建以及生理代谢都起着不可或缺的作用。它们的功能及演化也正在被逐步阐明。关键词：重复序列；基因组；基因调控网络中图分类号：Q75随着许多生物基因组测序工作的完成，大量的重复序列（repetitive sequence）被发现。重复序列在病毒和原核生物中很少出现；在真核生物中重复序列则广泛分布。它不仅在顺式调控元件如启动子、增强子、终止子处被大量发现，而且，很多rRNA基因和组蛋白基因本身就呈重复排列，称为基因簇。更为重要的是，它能够促使核酸形成高级结构，最终分化为常染色质（euchromatin。
基因组中重复序列的意义 生物信息学的研究重点主要体现在基因组学和蛋白质学两方面，具体地说就是从核酸和蛋白质序列出62616964757a686964616fe58685e5aeb931333433653939发，分析序列中表达结构和功能的生物信息。生物信息学的基本任务是对各种生物分析序列进行分析，也就是研究新的计算机方法，从大量的序列信息中获取基因结构、功能和进化等知识。而在序列分析中，将未知序列同已知序列进行相似性比较是一种强有力的研究手段，从序列的片段测定，拼接，基因的表达分析，到RNA和蛋白质的结构功能预测。物种亲缘树的构建都需要进行生物分子序列的相似性比较。生物信息学中的序列比对算法的研究具有非常重要的理论意义和实践意义。基因组中由寡核苷酸串联，重复排列的DNA序列，构成数量可变的串联重复序列，其中，微卫星DNA又称为短串联重复片列，是一种可遗传的不稳定的且具有高度多态性的短核苷酸重复序列，具有种类多，分布广，高度多态性等特点，这种多态性标志已广泛用于遗传病及亲子鉴定等.短序列比对中，一般常用的算法主要有三个：（1）空位种子片段索引法，首先将读段切分，并选取其中一段或几段作为种子建立搜索索引，再通过查找索引、延展匹配来实现读段定位，通过轮换种子考虑允许出现错配）的。
基因组重复序列的特点 1.高度重复序列 重复几百万次，一般是少于10个核苷酸残基组成的短片段.如异染色质上的卫星DNA.它们是不翻译的片段.在小鼠中约占基因组的10%.（重复序列是为了大量合成蛋白质和核酸）2.中度重复序列 重复次数为.
