水体污染控制与治理科技重大专项管理办法的第五章 资金管理 第三十二条 水专项经费来源于中央财政投入、地方财政投入以及企业、金融机构和社会资金投入。中央财政投入主要用于水专项实施过程中市场机制不能有效配置资源的基础性和公益性研究，以及企业竞争前的共性技术和重大关键技术研究开发等，地方财政投入和企业等资金投入主要用于技术的工程示范、产业化及相关研究。中央财政、地方财政和社会资金应统筹安排、使用和管理。第三十三条 牵头组织单位根据财政部核定的分阶段概算和年度预算控制数按照部门预算管理的有关要求组织编制年度预算建议，水专项领导小组审核后，报财政部，抄送科技部和发展改革委。第三十四条 财政部正式批复牵头组织单位水专项年度预算，由牵头组织单位按照财政资金支付管理的有关规定向项目（课题）承担单位拨付经费。第三十五条 统筹使用各方面的资金投入，提高资金使用效益。省级协调领导小组、示范项目（课题）所在地方政府应确保配套资金及时、足额到位。来源于中央和地方财政的专项经费，严格执行国家预算管理和财政资金管理的有关规定；其他来源资金，按照“谁出资、谁监管”的原则和相应的管理规定进行管理。重大专项资金要严格按照国家有关规定，单独核算、专款专用。第三十六条 水专项办。
国家级专项规划管理暂行办法的第八章 附 则 第二十三条 国务院有关部门组织编制的非国家级专项规划，应参照本办法加强内部管理，确保规划编制质量。第二十四条 国家级专项规划编制工作所需经费，由规划编制部门商财政部门列入部门预算。第二十五条 本办法由发展改革部门负责解释。第二十六条 本办法自二○七年五月一日起施行。
水体污染控制与治理科技重大专项管理办法的第二章 组织机构与职责 第五条 水专项的组织实施由国务院统一领导，国家科技教育领导小组统筹协调和指导。科技部会同发展改革委、财政部做好专项实施中的方案论证、综合平衡、评估验收和研究制定配套政策工作。水专项领导小组由国务院批准成立，对水专项组织实施承担领导责任。水专项领导小组各成员单位充分发挥部门优势，配合做好水专项的组织实施工作。水专项牵头组织单位环境保护部和住房城乡建设部（以下简称“牵头组织单位”），在水专项领导小组的领导下，负责水专项的具体组织实施，是保证水专项顺利组织实施并完成预期目标的责任主体。水专项管理办公室（以下简称“水专项办”）在水专项领导小组和牵头组织单位的统一领导下，承担水专项领导小组办公室和水专项实施管理办公室的职能，负责水专项实施的日常工作。水专项重点流域跨省协调领导小组、省级协调领导小组和示范项目（课题）所在地方政府负责组织协调和推动本辖区内相关项目（课题）的实施，负责配套保障条件的落实，参与项目（课题）的立项、监督检查、评估和验收等工作。第六条 水专项领导小组的主要职责是：（一）组织制订水专项实施方案；（二）批准水专项办、重点流域跨省协调领导小组、水专项总体专家组和主题专家组。
