ZKX's LAB

基因组注释的系统方法 基因组注释文件重复

2021-04-26知识6

refseq和ucsc人类基因组注释文件哪个质量更高UCSC Genome Browser是由University of California Santa Cruz(UCSC)创立和维护的,该站点包含有人类、小鼠和大鼠等多个物种的基因组草图,并提供一系列的网页分析工具。站点用户可以通过它可靠和迅速地浏览基因组的任何一部分,并且同时可以得到与该部分有关的基因组注释信息,如已知基因,预测基因,表达序列标签,信使RNA,CpG岛,克隆组装间隙和重叠,染色体带型,小鼠同源性等。用户也可以因为教育或科研目的加上他们自己的注释信息。UCSC Genome Browser目前应用相当广泛,比如Ensembl 就是使用它的人类基因组序列草图为基础的。

求助:病毒全基因组注释,分析,及可视化 HBV基因组又称为HBVDNA,其结构独特而精密,由不完全的环状双链DNA组成,长的为负链,短的为正链。负链含3200个碱基,正链的长度可变。HBV基因组中4个开放读码框(ORF)均位于负链,分别为S区、C区、P区、X区。S区又分为前S1、前S2及S三个编码区,分别编码包膜上的前S1蛋白、前S2蛋白及HBsAg。前S蛋白有很强的免疫原性,HBV的嗜肝性主要由前S蛋白与肝细胞受体之间的识别和介导的。C区又分为前C基因和 C基因,编码HBeAg和HBcAg。从前C基因开始编码的蛋白质经加工后分泌到细胞外即为HBeAg;从C基因开始编码的蛋白质为HBcAg。P区是最长的读码框架,编码一个大分子碱性多肽,分子量约为90KD,含有多种功能蛋白。X基因编码X蛋白,即HBxAg。HBxAg具有反式激活作用,可激活HBV本身的、其他病毒的或细胞的多种调控基因,促进HBV或其他病毒(如艾滋病病毒)的复制。

知道基因组怎么知道基因是否注释 在线的基因注释资源对于基因组数据的分析来说必不可少注释就是对代码的解释和说明.目的是为了让别人和自己很容易看懂。.

#基因组注释信息分析#基因组注释文件重复

随机阅读

qrcode
访问手机版