医药生物技术国家重点实验室（南京大学）的项目成果 多年来，实验室紧紧围绕以上三个研究方向，立足原始创新，2001年以来通过竞争共承担和完成各类研究项目350多项，年均研究经费约2000万元。实验室以承担国家级基础研究课题为主，约占项目总数的40%，研究经费约占总经费的80%，其中包括国家973项目（1项为首席主持）、国家863项目、国家十五重点攻关项目、国家科技基础性工作项目、国家杰出青年基金、国家自然科学基金重点项目等。100万以上的技术转让与合作开发项目20余项，合同金额达3440万元。建室以来，本室共获得各类奖项20多项，其中国家级奖4项，省部级奖9项，特别是“尿激酶原的蛋白质工程：结构和功能关系的研究”在尿激酶原（pro-UK）/尿激酶（UK）内源性催化活性的结构基础和生理学意义、pro-UK/UK的高效表达和复性研究以及第二代pro-UK/UK的设计和研究方面取得重大突破，于2000年获国家自然科学二等奖；“若干重要药用植物的成份研究”为植物内生真菌的认识与利用、相关新药的研发提供了新线索，建立的方法对相关研究具有广泛的参考价值，获2010年国家自然科学二等奖；获得国内发明专利61项，美国发明专利2项；实验室获新药临床批件12件；发表研究论文1200多篇，其中SCI论文800多篇，约占论文总数的70%，。
医药生物技术国家重点实验室（南京大学）的学术交流 建室以来，实验室积极进行多渠道、多元化的合作交流，与国内外高等院校、研究单位进行了广泛的合作研究与学术交流，取得很好的成效。已与美、日、法、澳等国的著名学术研究机构建立了长期学术交流关系，这些合作与交流对扩大我室在国际上的影响，提高学术水平，拓宽研究领域和了解国际学科前沿动态发挥了很大作用。自1995年对外开放以来，实验室共批准了50多项开放课题，其中1/4为国外开放课题，聚集了一批国内外优秀人才来室工作，有些开放课题取得较高水平的成果。例如日本德岛大学村松睦教授于1994-1999年在本实验室工作长达5年并获得国家友谊奖，合作研究的成果获得中、日、美、欧洲4项专利。另一方面，实验室人员积极参与国内外学术会议，多人次在国际会议上获得优秀论文奖，并先后参与组织与主办了国际会议8次。在新药研发上，中国缺少创新药物，更缺少具有自主知识产权的药物靶点、新的生物标记物和新的机制。实验室将在依托单位南京大学的有力支持下，努力做到真正与国际接轨，把自己的研究特色放在学科前沿研究上，加强对药物靶点的基础研究，争取为发现具有完全自主知识产权的药物靶点作出贡献。
淡水生态与生物技术国家重点实验室（中国科学院水生生物研究所）的项目成果 实验室围绕上述国内外相关学科领域的发展趋势和面临的国家重大需求，共承担科研究课题134项，其中主持的973国家重大基础研究项目2项，它们分别是湖泊富营养化过程与蓝藻水华暴发机理研究（2002年启动，2800万元，首席科学家刘永定研究员）和重要养殖鱼类品种改良的遗传和发育基础研究（2004年启动，2500万元，首席科学家桂建芳研究员），主持的863重大水专项2项，它们分别是受污染城市水体修复技术与工程示范（2003年启动，2583万元，首席科学家吴振斌研究员）和受纳湖湾污染负荷有效削减和生态系统重建技术与工程示范（2005年底启动，2000万元，首席科学家宋立荣研究员），还主持973课题3个，863课题6个，杰出青年基金3项，重点基金6项和欧盟项目1项等。这些项目的承担体现了实验室在国内外相同学科领域的地位和在国家科技发展和经济建设中的作用，同时也为实验室的学科发展和自主创新提供了必要条件。实验室共发表SCI收录论文247篇，并有相当多的论文被本学科领域国际顶尖级杂志接受发表，如SCIENCE，PNAS，DEV.BIOL.，MOL.BIOL.EVOL.，J.VIROL.等都发表有水生所完成的论文；发表的论文被国际同行广为引用，据不完全查证，其中105篇SCI论文被SCI刊源论文引用353次。
