生物信息学中的连锁分析与关联分析有哪些区别和联系？ 文献综述部分，不是生信专业的，看看对你有没有用处吧—…
什么是基因的遗传图谱 物理图谱，两者有何区别 遗传图谱：某一物种的染色体图谱（也就是我们所知的连锁图谱），显示所知的基因和/或遗传标记的相对位置，而不是在每条染色体上特殊的物理位置。采用遗传学分析方法将基因或其它DNA标记按一定的顺序排列在染色体上，这一方法包括杂交实验，家系分析。标记间的距离（遗传图距）用减数分裂中的交换频率来表示，单位为厘摩Centi-Morgan，cM)，每单位厘摩定义为1%交换率。遗传学图谱的解像度（分辨率）低，大约只能达到100万碱基对(1Mb)的水平。物理图谱：顾名思义，是DNA中一些可识别的界标（如限制性酶切位点、基因等）在DNA上的物理位置，图距是物理长度单位，如染色体的带区、核苷酸对的数量等两者异同：①遗传图谱是基于重组频率，物理图谱是基于直接测量的DNA结构。②减数分裂重组的频率并不统一沿大多数染色体。有一些热点和冷点在重组和或突变。热点和冷点会导致相当大的格律失真时，遗传图谱和物理地图并排排列时。③遗传图谱表示的是基因或标记间的相对距离，以重组值表示，单位CM④物理图谱表示的是基因或标记间的物理距离，距离的单位为长度单位，如μm或者碱基对数（bp或kp）等。简而言之前者是描述的基因相对位置，后者是具体的碱基位置二者存在的意义。
什么是QTL？如何确定QTL 的存在？ 1，QTL是quantitative trait locus的简称，指的是控2113制数量性状的基因5261在基因组中的位置。41022，QTL定位步骤：检测1653、内筛选亲容本并构建遗传群体；检测群体的分子标记基因型并构建分子标记连锁图谱；应用根据相应的统计模型和方法编写的计算机软件处理分析实验数据，确定分子标记与QTL的连锁关系及QTL在染色体上的区域。3，原理：当分子标记与某一性状QTL连锁时，不同标记基因型所对应表现性均值将存在显著差异。目前，用于作物数量性状QTL定位的分子标记主要有：限制性链裂片段长度多态性(RFLP)、随机扩增多态性DNA(RAPD)、简单序列长度多态性(SSR)和扩增片仿唤改段长度备判多态性(AFLP)。
