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疾病相关基因整合信息数据库 小鼠染色体的特点

2021-04-24知识4

为什么个性化医疗要以基因测序和生物信息为基础? 1:定量PCR、液相芯片、毛细管测序等都是低通量检测已知少数几个致癌基因,而基因组测序则是高通量检测.

分析miRNA的数据库都有哪些 1、starBase一个高通量实验数据CLIP-Seq(或称为HITS-CLIP,PAR-CLIP,iCLIP)和mRNA降解组测序数据支持的microRNA靶标数据库,包含了miRNA-mRNA,miRNA-lncRNA,miRNA-circRNA,miRNA-ceRNA 和RNA-protein等的调控关系。整合和构建多个流行的靶标预测软件的交集和调控关系。最新版本发布时间:2013年11月。2、miRbase众所周知的microRNA基因注释数据库。目前miRBase只提供了microRNA的靶标的预测软件的链接(如:PicTar)。最新版本发布时间:2010年9月。3、ChIPBase整合CLIP-Seq和ChIP-Seq的数据探讨microRNA的转录和转录后调控,构建转录因子->;microRNA->;靶标的调控网络。最新版本发布时间:2012年11月。4、Tarbase一个收集已被实验验证的microRNA靶标数据库。最新版本发布时间:2009年1月。5、miRecords一个整合的microRNA靶标数据库。整合多个靶标预测软件的调控关系。最新版本发布时间:2010年11月。6、targetScan基于靶mRNA序列的进化保守等特征搜寻动物的microRNA靶基因。是预测microRNA靶标假阳性率较低的软件。而且是microRNA领域大牛Bartel实验室开发的。最新版本发布时间:2009年4月。7、PicTar基于microRNA或microRNA靶标联合作用等特征开发的搜寻。

欧蒙宏基因组检测主要用到了哪些数据库,各自的主要功能是什么? 欧蒙未一病原体基因组数据库主要是对NCBI、PATRIC、EuPathDB、VIPR等公共数据库的整合,涵盖数万种病原体,并构建涵盖上千种明确具有致病性物种的核心数据库。NCBI数据库:美国生物技术信息中心,可查询序列、文献;PATRIC:美国病原体系统资源整合中心,致力于整合耐药基因组数据库;EuPathDB:真核生物病原体数据库;VIPR:病毒病原资源数据库;核心数据库:以庞大的公共数据库资源为背景,结合文献、书籍,疾病类型,临床经验积累,整理更具针对性的致病病原体库。

#疾病相关基因整合信息数据库

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