基因组重复序列的特点 最低0.27元开通文库会员,查看完整内容>;原发布者:kjxyzxh知识介绍《生命的化学》2008年28卷3期CHEMISTRY OF LIFE 2008,28(3)·343·文章编号:1000-1336(2008)03-0343-03 基因组中重复序列的意义艾对元(兰州大学化学系功能有机分子化学国家重点实验室,兰州 730000)摘要:从原核生物到真核生物,其基因组中的重复序列呈递增趋势。重复序列的作用也被各种实验所揭示。各种重复序列的类型与它在e799bee5baa6e997aee7ad94e78988e69d8331333433623763染色体上的分布密切相关。重复序列不是垃圾,而是影响着生命的进化、遗传、变异;同时它对基因表达、转录调控、染色体的构建以及生理代谢都起着不可或缺的作用。它们的功能及演化也正在被逐步阐明。关键词:重复序列;基因组;基因调控网络中图分类号:Q75随着许多生物基因组测序工作的完成,大量的重复序列(repetitive sequence)被发现。重复序列在病毒和原核生物中很少出现;在真核生物中重复序列则广泛分布。它不仅在顺式调控元件如启动子、增强子、终止子处被大量发现,而且,很多rRNA基因和组蛋白基因本身就呈重复排列,称为基因簇。更为重要的是,它能够促使核酸形成高级结构,最终分化为常染色质(euchromatin。
识别序列定义 基因组DNA分子可以根据其结构和功能从不同角度分成不同的类别。
SSR的重复序列 最低0.27元开通文库会员,查看完整内容>;原发布者:雪之情思单一序列(uniquesequence)又称非重复序列,在一个基因组中一般只有一个拷贝。真核生物的绝大多数结构基因在单倍体中是单拷贝或几个e5a48de588b6e79fa5e9819331333433623764拷贝(1~5个拷贝)。基因组中有10个到几千个拷贝的DNA序列。重复单元的平均长度约300b中度重复序列(moderatelyrepetitivesequence)一般是非编码序列,有十个到几百个拷贝,如rRNA基因和tRNA基因等。这类重复序列的平均长度大约为300bp,往往构成序列家族,常以回文序列形式出现在基因组的许多位置上,有些同单一序列间隔排列。大部分中度重复序列与基因表达的调控有关,包括开启或关闭基因的活性,调控DNA复制的起始,促进或终止转录等,它们可能是与DNA复制和转录的起始、终止等有关的酶和蛋白质因子的识别位点。p。高度重复序列在基因组中重复频率高,可达百万(106)以上,因此复性速度很快。在基因组中所占比例随种属而异,约占10-60%,在人基因组中约占20%。高度重复顺序又按其结构特点分为三种。(1)倒位(反向)重复序列 这种重复顺序复性速度极快,即使在极稀的DNA浓度下,也能很快复性,因此又称零时复性部分,约占人基因组的5%。反向重复。