很多肾结石患者的尿沉渣中可以观察到多种晶体。其实我们可以通过这些残渣晶体来判断患者肾结石的病理性。一般情况下这都是有迹可循的。
它们可能是非病理性的，或者是由内源性结晶、外源性药物引发的肾病（肾结石，AKI 等）产生的。结晶的形成可继发于遗传性疾病、代谢紊乱和药物暴露。结晶的鉴别应先在明视野或相差显微镜下观察晶体外观并观察折光性，例如尿酸、草酸钙、磷酸钙和三磷酸盐结晶具有100%双折射现象。除了这些，还要注意尿液 pH 值，因为不同结晶形成的酸碱环境不同。
由于晶体对肾实质和尿路上皮的研磨作用，结晶尿可能出现在温和的尿沉渣中，或伴随血尿和白细胞尿，因此并非所有的结晶尿都是病理性的。
总之，显微镜尿沉渣检查是肾脏病学家的基本诊断工具，目前还不能完全被替代。
