ZKX's LAB

基因组重复序列的特点 病毒 基因组 重复序列

2021-04-08知识1

RNA逆转录形成的DNA有没有启动子?如果没有,这个DNA又怎样转录出mRNA? 有些病毒(如艾滋病病毒)通过逆转录形成DNA,这些DNA又可以转录成mRNA。但是RNA没有启动子对应的密码子…

如何破解新冠病毒基因组全长序列? 正如如大家所知,高通量测序在新冠病毒的鉴定及诊断中可以和RT-PCR法形成互补,这样不仅能够提高阳性检出率,而且还能进行并发检测,以提供更多的可能感染的病原信息。其中更为重要的是,高通量测序还可以对病毒的序列进行组装,以获得病毒的全长基因组信息,这样为追溯病毒的来源、监测病毒的变异趋势以及探究致病机理提供了研究基础。科学家们为了获取完整的病毒基因组的序列,目前广泛应用到的高通量测序技术,就是将核酸序列打断成短片段从而进行测序,然后通过相应的分析软件将测得的短序列再进行拼接组装。然而,新型冠状病毒是一种新发病毒,人们在基因测序的深度、测序准确性以及重复序列比例等方面,到目前来讲还没有形成具有参考意义的经验值。那么也就是说如果要将海量的短序列还原出原始的基因组序列,则有可能会在序列拼接中出现以下问题:首先,出现测序错误,从而导致某些重叠的可信度低;再者,基因组序列的不完全覆盖以及高重复序列的干扰会影响基因短序列拼接的准确性和完整性;最后,宏转录组测序样本中的人源序列占到了85%以上,而病原序列仅占到5%左右,这就使得病毒基因组序列的拼接难度更高。了为避免样本在采样、保存和运输过程中因不确定性。

高中常见的逆转录病毒和非逆转录病毒有哪些? 逆转录病毒(Retrovirus),又称反转录病毒,属于RNA病毒中的一类,它们的遗传信息不是储存在脱氧核糖核酸(DNA),而是储存在核糖核酸(RNA)上,此类病毒是已知的唯一。

随机阅读

qrcode
访问手机版