依据一份发表在欧洲预防心脏病学杂志上的研究，黑巧克力对心脏健康有益。
该研究显示，巧克力可以保持心脏血管的健康。其中含有对心脏健康有益的营养物，比如黄酮类，多酚类，以及硬脂酸。这些物质可以减轻炎症，增加有益的胆固醇。巧克力富含抗氧化剂，可以帮助减轻炎症，改善血流，振奋情绪，提高注意力。
可可豆类的产品比大多数食物含有更多的植物性抗氧化剂和原花青素。原花青素可以阻止有害胆固醇的摄取。
巧克力中的抗氧化剂可以维持其功效至少50周，而可可豆以及可可粉中的抗氧化剂可以保持稳定长达75年之久。绿茶中也含有抗氧化剂，但在保存期内会降解。
该研究回顾性查阅了过去50多年的研究，发现每周吃巧克力超过一次与冠状动脉疾病的患病风险降低8%有关联性。
早期的研究也印证了这种益处。摄取可可类食物与冠心病发病率显著降低以及任何因素造成的死亡率显著降低有关联性。它可以阻止血管壁内的斑块形成，并可以降低血压。有助于预防中风和心衰。
巧克力与改善大脑血供也有关，可能有助于改善认知功能。在健身的时候巧克力可能增强体内氧气的运输能力。但有研究显示，巧克力对皮肤健康不利，与皮肤痤疮的发病有关联。
巧克力的颜色越暗，其中的可可含量越高。但是，如果黑巧克力被生产者进行了深加工，其对人体健康的益处会下降。应选择没有被碱中和其所含天然酸性物质的可可粉。这种处理方法通常被称为荷兰工艺（Dutch processing）。
与白巧克力相比，黑巧克力所含的糖以及热量更低。吃适量的巧克力似乎可以保护冠状动脉，但大量的摄入会适得其反。可以在饮食中加入其它富含黄酮类的食物，比如苹果，茶，柑橘，洋葱，浆果类（葡萄，西红柿等）。
常见的巧克力商品中含有热量，糖，奶，以及脂肪，对糖尿病和肥胖患者健康不利。
