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宏基因组重复 宏基因组测序对样品的生物学重复有什么要求?

2021-04-07知识8

请问如果DNA浓度太低不够做宏基因组能不能够进行PCR扩增啊先,我们的实验材料真的很特殊,没法再多了. 所谓宏基因组是指对某一特定区域或环境下所有微生物DNA的总和,也就是说对你已知或未知的所有可测的DNA的一个总的测序,然后通过比较或分析core 基因得出整体的基因组分布,不知道你要做的是这个吗?扩增后如果只是测特定基因的序列,还算宏基因组吗?我也只是半吊子,算是和楼主共同学习吧.实际上最后能先说一下你的实验目的和设计,这样子才好分析PCR扩增后对你的结果会不会有影响啊.

DNA的离心原理 9,000 g离心得到的是细胞碎片,微生物还有较少的杂质,蛋白质被除去,大多数密度较小的杂质被除去;200 g离得是杂质,上清液中是所要的细胞,微生物。需要反复离心纯化。PBS具有盐平衡、适宜pH缓冲作用,也就是对生物制剂有个保护作用。用STE是使微生物裂解释放DNA,离心收集。重悬就是获得液体环境,进行下一步实验。至于离心时间不是参考值,就是经验值,基本都是这样吧。可以查一下细胞内物质的离心参数

宏基因组测序 二、生物信息分析内容 1.测序质量分析与统计、评估 2.数据库比对;3.物种丰度分析;4.功能基因注释;5.基因功能丰度差异分析;6.Pathway富集分析;7.丰度差异。三、结果展示 。

#宏基因组重复

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