ZKX's LAB

如何从一个细菌的全基因组中找出目的基因? 如何在全基因组找基因重复

2021-04-06知识2

为什么真核基因组含有大量重复序列 真核生物的基因组一般比较庞大,例如人的单倍体基因组由3×106 bp碱基组成,按1000个碱基编码一种蛋白质计,理论上可有300万个基因。但实际上,人细胞中所含基因总数大概会。

真核基因组的中度重复顺序 在原核生物如大肠杆菌基因组中,rRNA基因一共是七套;在真核生物中rRNA基因的重复次数更多。在真核生物基因组中18S和28S,rRNA基因是在同一转录单位中,低等的真核生物如酵母中,5SrRNA也和18S,28SrRNA在同一转录单位中;而在高等生物中,5SrRNA是单独转录的,而且其在基因组中的重复次数高于18S和28S基因。和一般的中度重复顺序不一样,各重复单位中的rRNA基因都是相同的。rRNA基因通常集中成簇存在,而不是分散于基因组中,这样的区域称为rDNA,如染色体的核仁组织区(nucleolus organizer region)即为rDNA区。18S和28SrRNA基因构成一个转录单位。从转录单位上转录下来的rRNA前体经过酶切成为18S和28SrRNA。在哺乳动物和两栖动物中,18S和28SrRNA之间一同被转录下来的间隔区经过加工成为5.8SrRNA(在大肠杆菌中该区含有tRNA序列)。rRNA前体的其它部份被降解成核苷酸。真核生物中每个转录单位约长7-8kb(在哺乳动物中长13kb),其中编码rRNA的部份占70-80%(哺乳动物中只占50%左右)。一个rRNA基因簇(rDNA簇)含有许多转录单位,转录单位之间为不转录的间隔区,该间隔区由21-100bp片段组成的类似卫星DNA的串联重复顺序。转录单位和不转录的间隔区构成一个rDNA重复。

真核生物基因组中的dna重复序列主要有哪些类型 1.高度重复序列重复几百万次,一般是少于10个核苷酸残基组成的短片段。如异染色质上的卫星DNA。它们是不翻译的片段。2.中度重复序列重复次数为几十次到几千次。如rRNA基因、tRNA基因和某些蛋白质(如组蛋白、肌动蛋白、角蛋白等)的基因。3.单一序列在整个基因组中只出现一次或少数几次的序列(也称为单拷贝序列或单拷贝基因),在小鼠中约占基因组的70%。如珠蛋白基因、卵清蛋白基因、丝心蛋白基因等。实验证明,所有真核生物染色体可能均含重复序列而原核生物一般只含单一序列。高度和中度重复序列的含量随真核生物物种的不同而变化。

#如何在全基因组找基因重复

随机阅读

qrcode
访问手机版