DNA重复序列 你说的两种情况都是有的。我们遗传学课本上的定义是：重复序列是指在基因组中重复出现的DNA序列，根据其在基因组中重复频率特点又可分为串联重复序列和分散重复序列。
对于一段有重复序列的片段如何扩增，只是一个基因的中间的部分序列，准备扩增做overlap。 1.如果是非特异性扩增引起的无法扩增目的条带，那么可以提高退火温度，或者换酶，或者先切胶回收较浅的目的条带，再次扩增2.如果退火温度太高，可以用两步法扩增3.如果引物GC值太高，可以加DMSO
基因组中重复序列的意义 生物信息学的研究重点主要体现在基因组学和蛋白质学两方面，具体地说就是从核酸和蛋白质序列出62616964757a686964616fe58685e5aeb931333433653939发，分析序列中表达结构和功能的生物信息。生物信息学的基本任务是对各种生物分析序列进行分析，也就是研究新的计算机方法，从大量的序列信息中获取基因结构、功能和进化等知识。而在序列分析中，将未知序列同已知序列进行相似性比较是一种强有力的研究手段，从序列的片段测定，拼接，基因的表达分析，到RNA和蛋白质的结构功能预测。物种亲缘树的构建都需要进行生物分子序列的相似性比较。生物信息学中的序列比对算法的研究具有非常重要的理论意义和实践意义。基因组中由寡核苷酸串联，重复排列的DNA序列，构成数量可变的串联重复序列，其中，微卫星DNA又称为短串联重复片列，是一种可遗传的不稳定的且具有高度多态性的短核苷酸重复序列，具有种类多，分布广，高度多态性等特点，这种多态性标志已广泛用于遗传病及亲子鉴定等.短序列比对中，一般常用的算法主要有三个：（1）空位种子片段索引法，首先将读段切分，并选取其中一段或几段作为种子建立搜索索引，再通过查找索引、延展匹配来实现读段定位，通过轮换种子考虑允许出现错配）的。
