怎么判别基因家族中的串联重复基因 怎么判别基因家族中的串联重复基因基因簇 基因家族中来源相同、结构相似和功能相关的基因在染色体上彼此紧邻所构成的串联重复单位。.
如何找出序列中短重复片段并标注 基因组中由寡核苷酸串联，重复排列的DNA序列，构成数量可变的串联重复序列，其中，微卫星DNA又称为短串联重复片列，是一种可遗传的不稳定的且具有高度多态性的短核苷酸重复序列，具有种类多，分布广，高度多态性等特点，这种多态性标志已广泛用于遗传病及亲子鉴定等.短序列比对中，一般常用的算法主要有三个：（1）空位种子片段索引法，如MAQ、ELAND等，首先将读段切分，并选取其中一段或几段作为种子建立搜索索引，再通过查找索引、延展匹配来实现读段定位，通过轮换种子考虑允许出现错配（mismatch）的各种可能的位置组合；（2）Burrows Wheeler转换法，如Bowtie、BWA、SOAP2等，通过B-W转换将基因组序列按一定规则压缩并建立索引，再通过查找和回溯来定位读段，在查找时可通过碱基替代来实现允许的错配；（3）Smith-Waterman动态规划算法，如BFAST，SHRiMP等，利用初始条件和迭代关系式计算两个序列的所有可能的比对分值，并将结果存放于一个矩阵中，利用动态规划的方法回溯寻找最优的比对结果。
根据以下资料回答问题： （1）C-T之间配对需要由3个氢键才可以形成碱基对，A-T碱基对需要2个氢键．高温可将DNA解旋断裂氢键形成单链．氢键越多，温度越高，因此解旋温度越高，则说明DNA中G-C碱基对的比例越大．（2）若亲代STR有50个碱基对，则亲代关于STR基因的基因型都是杂合子，即一条染色体上的STR基因含有32bp、其同源染色体上的STR基因含有18bp，则图2中个体C是系谱图中的患甲病，甲病为STR（双隐），则图2中个体C是系谱图中的Ⅱ-1号个体，因此可看出STR长度为18bp的DNA片段为STR隐性基因；但图2中Ⅲ-3从遗传系谱图看是患甲病的，从图2看Ⅲ-3是杂合子，不患甲病，和系谱图中不符．（3）若图1中Ⅱ-1为疑似拉登，则与Ⅰ-1的STR电泳结果相比，条带相同的概率为12，若Ⅱ-5为其姐姐甲，二者是同父异母，则对比姐弟俩的STR电泳结果，条带相同的概率最大为12，要得到99.99%相同概率的结论，则必须与本人DNA电泳结果对比．故答案为：（1）G-C（2）Ⅱ-1 18Ⅲ-3（3）12 12 本人
