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真核生物基因组中的dna重复序列主要有哪些类型 基因组重复序列占比高对组装的影响

2021-04-04知识6

4. 人类基因组中存在着重复单位为2~6bp的重复序列,称为: 微卫星2113DNA微卫星DNA:重复单位序列5261最短,只有2~6bp,串联成簇,长度50~100bp,又4102称为短串联重1653复序列(Short Tandem Repeat STR)。广泛分布于基因组中。其中富含A-T碱基对,是在研究DNA多态性标记过程中发现的。1981年Miesfeld等首次发现微卫星DNA,其重复单位长度一般为1~6个核苷酸,双核苷酸重复单位常为(CA)n和(TG)n。

真核生物基因组中的dna重复序列主要有哪些类型 1.高度重复序列重复几百万次,一般是少于10个核苷酸残基组成的短片段。如异染色质上的卫星DNA。它们是不翻译的片段。2.中度重复序列重复次数为几十次到几千次。如rRNA基因、tRNA基因和某些蛋白质(如组蛋白、肌动蛋白、角蛋白等)的基因。3.单一序列在整个基因组中只出现一次或少数几次的序列(也称为单拷贝序列或单拷贝基因),在小鼠中约占基因组的70%。如珠蛋白基因、卵清蛋白基因、丝心蛋白基因等。实验证明,所有真核生物染色体可能均含重复序列而原核生物一般只含单一序列。高度和中度重复序列的含量随真核生物物种的不同而变化。

为什么真核基因组含有大量重复序列 真核生物的基因组一般比较庞大,例如人的单倍体基因组由3×106 bp碱基组成,按1000个碱基编码一种蛋白质计,理论上可有300万个基因。但实际上,人细胞中所含基因总数大概会。

#基因组重复序列占比高对组装的影响

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