16sRNA测序技术与高通量测序技术有什么区别？ 距离上次《生信宝典》联合《宏基因组》组织的扩增子分析线下培训结束己经有三个多月了。为方便广大读者的…
请问如果DNA浓度太低不够做宏基因组能不能够进行PCR扩增啊先，我们的实验材料真的很特殊，没法再多了. 所谓宏基因组是指对某一特定区域或环境下所有微生物DNA的总和，也就是说对你已知或未知的所有可测的DNA的一个总的测序，然后通过比较或分析core 基因得出整体的基因组分布，不知道你要做的是这个吗？扩增后如果只是测特定基因的序列，还算宏基因组吗？我也只是半吊子，算是和楼主共同学习吧.实际上最后能先说一下你的实验目的和设计，这样子才好分析PCR扩增后对你的结果会不会有影响啊.
宏基因组的阳性率大概是多少？ 根据文献、专家报告，宏基因组在中枢神经系统感染等相对成熟的领域病原检出阳性率高达50%~60%。在血流感染中，阳性率30%左右，前者在重症感染中占比高达70%~80%。
DNA的离心原理 9，000 g离心得到的是细胞碎片，微生物还有较少的杂质，蛋白质被除去，大多数密度较小的杂质被除去；200 g离得是杂质，上清液中是所要的细胞，微生物.需要反复离心纯化.PBS具有盐平衡、适宜pH缓冲作用，也就是对生物制剂有个保护作用.用STE是使微生物裂解释放DNA，离心收集.重悬就是获得液体环境，进行下一步实验.至于离心时间不是参考值，就是经验值，基本都是这样吧.可以查一下细胞内物质的离心参数
宏基因组测序对样品的生物学重复有什么要求？ 土壤、水体2113等生态环境样本建议5个或5个以上的生物学5261重复；取样时每个4102样品均需多点取样后混匀，降1653低单个样本特异性。人和动物样本因个体特异性较大，建议10个以上生物学重复；肠道、瘤胃或粪便样本因含有较多厌氧菌，要快速取样、迅速低温保存，针对较难富集微生物的样品，如各种物体表面，可采用缓冲液洗脱或棉签擦拭等方法。样品取好后避免长时间放置，需尽快进行DNA提取，送样测序。
如何自学生物信息学？ 入门篇 ？ mp.weixin.qq.com 。期间做过很多大型的人类基因组学项目（https：//www.researchgate.net/profile/Shujia_Huang/contributions），因此在这里我想结合自己的体会。
宏基因组测序 二、生物信息分析内容 1.测序质量分析与统计、评估 2.数据库比对；3.物种丰度分析；4.功能基因注释；5.基因功能丰度差异分析；6.Pathway富集分析；7.丰度差异。三、结果展示 。
三代测序原理及实验过程，随着社会的进步，生物信息技术越来越发达，大家想了解三代测序PacBioRS平台资料吗？不妨来看一下吧。
宏转录组测序与宏基因组测序使用同一种设备吗 基因组，Genome，一般的定义是单倍体细胞中的全套染色体为一个基因组，或是单倍体细胞中的全部基因为一个基因组。可是基因组测序的结果发现基因编码序列只占整个基因组序列的很小一部分。因此，基因组应该指单倍体细胞中包括编码序列和非编码序列在内的全部DNA分子。说的更确切些，核基因组是单倍体细胞核内的全部 DNA分子；线粒体基因组则是一个线粒体所包含的全部DNA分子；叶绿体基因组则是一个叶绿体所包含的全部DNA分子转录组（transcriptome）广义上指某一生理条件下，细胞内所有转录产物的集合，包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA；狭义上指所有mRNA的集合。从定义上看，很明显，基因组一般指的是DNA（某些只含有RNA的生物除外），而转录组则指的是RNA。
