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全基因合成钱对目的基因序列进行GC含量和重复序列分析的软件是什么? 基因重复序列含量

2021-03-24知识10

为什么真核基因组含有大量重复序列 真核生物的基因组一般比较庞大,例如人的单倍体基因组由3×106 bp碱基组成,按1000个碱基编码一种蛋白质计,理论上可有300万个基因。但实际上,人细胞中所含基因总数大概会。

全基因合成钱对目的基因序列进行GC含量和重复序列分析的软件是什么? 生物信息学各个领域中的软件数目庞大,在EBI 1997年的分子生物学程序目录中就收录了530多种常用软件。序列比对和数据库搜索软件有BLAST,FASTA,BLITZ等;。

基因组重复序列的特点 最低0.27元开通文库会员,查看完整内容>;原发布者:kjxyzxh知识介绍《生命的化学》2008年28卷3期CHEMISTRY OF LIFE 2008,28(3)·343·文章编号:1000-1336(2008)03-0343-03 基因组中重复序列的意义艾对元(兰州大学化学系功能有机分子化学国家重点实验室,兰州 730000)摘要:从原核生物到真核生物,其基因组中的重复序列呈递增趋势。重复序列的作用也被各种实验所揭示。各种重复序列的类型与它在e799bee5baa6e997aee7ad94e78988e69d8331333433623763染色体上的分布密切相关。重复序列不是垃圾,而是影响着生命的进化、遗传、变异;同时它对基因表达、转录调控、染色体的构建以及生理代谢都起着不可或缺的作用。它们的功能及演化也正在被逐步阐明。关键词:重复序列;基因组;基因调控网络中图分类号:Q75随着许多生物基因组测序工作的完成,大量的重复序列(repetitive sequence)被发现。重复序列在病毒和原核生物中很少出现;在真核生物中重复序列则广泛分布。它不仅在顺式调控元件如启动子、增强子、终止子处被大量发现,而且,很多rRNA基因和组蛋白基因本身就呈重复排列,称为基因簇。更为重要的是,它能够促使核酸形成高级结构,最终分化为常染色质(euchromatin。

真核生物基因组高度重复序列的功能有哪些 1.高度重复序列bai重复几百万次,du一般是少于zhi10个核苷酸残基dao组成的短片段。如异染色回质上的卫星DNA。它们是不答翻译的片段。2.中度重复序列重复次数为几十次到几千次。如rRNA基因、tRNA基因和某些蛋白质(如组蛋白、肌动蛋白、角蛋白等)的基因。3.单一序列在整个基因组中只出现一次或少数几次的序列(也称为单拷贝序列或单拷贝基因),在小鼠中约占基因组的70%。如珠蛋白基因、卵清蛋白基因、丝心蛋白基因等。实验证明,所有真核生物染色体可能均含重复序列而原核生物一般只含单一序列。高度和中度重复序列的含量随真核生物物种的不同而变化。

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真核生物基因组中的dna重复序列主要有哪些类型 1.高度重复序列重复几百万次,一般是少于10个核苷酸残基组成的短片段。如异染色质上的卫星DNA。它们是不翻译的片段。2.中度重复序列重复次数为几十次到几千次。如rRNA基因、tRNA基因和某些蛋白质(如组蛋白、肌动蛋白、角蛋白等)的基因。3.单一序列在整个基因组中只出现一次或少数几次的序列(也称为单拷贝序列或单拷贝基因),在小鼠中约占基因组的70%。如珠蛋白基因、卵清蛋白基因、丝心蛋白基因等。实验证明,所有真核生物染色体可能均含重复序列而原核生物一般只含单一序列。高度和中度重复序列的含量随真核生物物种的不同而变化。

基因重组技术有哪几个方面的应用 1、抗虫棉抗虫棉之所以抗虫,是因为外源Bt基因整合到棉株体中后,可以在棉株体合成一种叫δ-内毒素的伴孢晶体,该晶体是一种蛋白质晶体,被鳞翅目等敏感昆虫的幼虫吞食后,在其肠道碱性条件和酶的作用下,或单纯在碱性条件下,伴孢晶体能水解成毒性肽,并很快发生毒性。2、环境保护上“DNA探针”可以十分灵敏地检测环境中的病毒、细菌等污染,且不易因环境污染而大量死亡,甚至还可以吸收和转化污染物。通常一种细菌只能分解石油中的一种烃类,用基因工程培育成功的“超级细菌”可以分解石油中的多种烃类化合物,有的还能吞食转化汞、镉等重金属,分解DDT等毒性物质3、畜牧业上转基因技术在畜牧业有着广阔的应用前景。首先可以改良畜禽生产性状。通过转基因技术,可使动物自身合成某些氨基酸,改变其生长调节系统,促进其生长性能,提高饲料的利用效率和缩短生长周期等。4、环境保护上“DNA探针”可以十分灵敏地检测环境中的病毒、细菌等污染,且不易因环境污染而大量死亡,甚至还可以吸收和转化污染物。通常一种细菌只能分解石油中的一种烃类,用基因工程培育成功的“超级细菌”可以分解石油中的多种烃类化合物,有的还能吞食转化汞、镉等重金属,分解DDT等毒性。

基因组中重复序列的意义 生物信息学的研究重点主要体现在基因组学和蛋白质学两方面,具体地说就是从核酸和蛋白质序列出62616964757a686964616fe58685e5aeb931333433653939发,分析序列中表达结构和功能的生物信息。生物信息学的基本任务是对各种生物分析序列进行分析,也就是研究新的计算机方法,从大量的序列信息中获取基因结构、功能和进化等知识。而在序列分析中,将未知序列同已知序列进行相似性比较是一种强有力的研究手段,从序列的片段测定,拼接,基因的表达分析,到RNA和蛋白质的结构功能预测。物种亲缘树的构建都需要进行生物分子序列的相似性比较。生物信息学中的序列比对算法的研究具有非常重要的理论意义和实践意义。基因组中由寡核苷酸串联,重复排列的DNA序列,构成数量可变的串联重复序列,其中,微卫星DNA又称为短串联重复片列,是一种可遗传的不稳定的且具有高度多态性的短核苷酸重复序列,具有种类多,分布广,高度多态性等特点,这种多态性标志已广泛用于遗传病及亲子鉴定等.短序列比对中,一般常用的算法主要有三个:(1)空位种子片段索引法,首先将读段切分,并选取其中一段或几段作为种子建立搜索索引,再通过查找索引、延展匹配来实现读段定位,通过轮换种子考虑允许出现错配)的。

生物基因组中大量的重复序列有什么作用?

多拷贝基因和大量重复序列不一样吗??有什么区别啊?!!急急急!!谢谢帮忙!! 多拷贝基因是一个基因序列的多次重复,是具有编码蛋白质的能力的。而多次重复序列则是非编码区的一种重复形式。

#基因重复序列含量

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