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什么是基因组扫描 基因组连锁不平衡表明什么

2021-03-24知识7

连锁不平衡的解析 例如两个相邻的基因A B,他们各自的等位基因为a b.假设A B相互独立遗传,则后代群体中观察得到的单倍体基因型 AB 中出现的P(AB)的概率为 P(A)*P(B).实际观察得到群体中单倍体基因型 AB 同时出现的概率为P(AB)。计算这种不平衡的方法为:D=P(AB)-P(A)*P(B).连锁不平衡分析在连锁不平衡程度的评估、复杂疾病精细定位以及研究人类的历史和迁移中得到了越来越广泛的应用。连锁不平衡又称等位基因关联(allelic association),其原理其实很简单。假定两个紧密连锁的位点1,2,各有两个等位型(A,a;B,b),那么在同一条染色体上将有四种可能的组合方式:A—B,A—b,a—B,和a—b。假定等位型A的频率为Pa,B的频率为Pb,那么如果不存在连锁不平衡(如组成单倍型的等位型间相互独立,随机组合)单倍型A—B的频率就应为PaPb。而如果A与B是相关联的,单倍型A—B的频率则应为PaPb+D,D是表示两位点间LD程度的值。如果位点2上的等位型B与疾病易患性有关,那么将会观察到等位型A的频率在病人群体中高于对照群体。换句话说,等位型A与该疾病性状相关。事实上,可以检测遍布基因组中的大量遗传标记位点,或者候选基因附近的遗传标记来寻找到因为与致病位点距离足够近。

什么叫连锁不平衡的衰减? 就是在基因组上,随着物理距离的增大,两个连锁的的等位基因的连锁程度不断减小。发现 等你来答 ? 加入知乎 什么叫连锁不平衡的。请发送邮件到 jobs@zhihu.com

懂分子遗传的高手请进:连锁(linkage)和连锁不平衡(LD)有什么区别? 简单点说,两个等位基因如果恰好在同一条染色体上,那么它们在遗传给子代的时候就不是随机分配的了,基本上在一起传递,这就是连锁。譬如,加上控制花颜色基因为A,红色,a。

Xist基因是什么? Xist基因的非编码性2113RNA是真哺乳亚纲哺5261乳动物(eutherian mammal)中X染色体失活过程的关键性4102起始物,1653然而它的精确功能和起源仍然不清楚。尽管Xist在真哺乳亚纲保守性较好,但在其他的哺乳动物动物中还未找到它的同源物。作者显示Xist至少部分上是从一个编码蛋白的基因进化而来的,而Xist原始类型(proto-Xist)的蛋白编码功能的丢失与Xist两端存在着四个蛋白编码的假基因相一致。这一事件在真哺乳亚纲动物和有袋动物(marsupial)进化上分开后发生,这就表明这两个世系(lineage)的剂量补偿进化机制是独立的。当哺乳动物从其他的羊膜动物(amniote)中分化出来后不久,哺乳动物的X和Y染色体便从一对常染色体中进化而来[1]。在哺乳亚纲动物和有袋动物中,雄性的XY染色体和雌性的XX染色体之间的基因剂量上的不平衡通过沉默雌性中的一条X染色体而得以弥补[2-4]。在哺乳亚纲动物里,这种沉默作用涉及Xist基因,该基因位于X染色体失活中心(X inactivation center,Xic),编码一个长的非翻译性的RNA[5]。Xic位于人类X染色体的长臂上,这与哺乳动物最后一个共同祖先(cenancestor)(6,7)原始的X染色体上的情形吻合。这种观察也也这一假设相一致,即在哺乳动物进化早期,。

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请问连锁不平衡状态的产生原因有哪些?在人类的基因组中,有许多原因都能导致连锁不平衡状态的产生,这其中包括随机遗传漂变(random genetic drift)、奠基者效应。

求高手翻译成英文,不要用软件,在线急等 为了明确光皮桦BlSPL2基因组结构,为其SNP分析提供基础,本研究根据cDNA序列设计特异引物,以光皮桦基因组总DNA为模板进行了PCR。

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