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组装完基因组重复基因好多 复杂基因组测序经典案例

2021-03-23知识7

关于基因组组装的问题,请问我如何去寻找被打散了的基因序列呢~~?先谢谢了~ 楼主你好,你是说使用类似鸟枪法测序时候如何讲所有的序列拼接起来是吧?是这样的,在一次测序中,一般会打碎很多很多很多的细胞基因组,因为是随机打碎成100-200bp的小片段,那么来自不同基因组的小片段之间是会有重复序列的,在人类基因组工程里的标准是有50bp的碱基对匹配就将两个片段拼接在一起,然后再去找他们两端的序列,50bp匹配,就拼接。一点一点像拼图一样拼起来。通常在同一个位置上至少需要20个片段覆盖才算是确认无误。然后还需要一些之前知道的知识,比如哪个基因在哪个染色体上,拼出带有这个已知基因的片段就是该染色体的片段~具体的原理如果有兴趣欢迎追问~希望对你有所帮助~

斜线部分均为扯淡,仅供娱乐。因为我不是程序员,所以吐槽请轻点:动物基因组和植物基因组有什么区别?魔…

真核生物基因组的结构特点有哪些 1、真核生物基因2113组DNA与蛋白质结合形成染5261色体,储存在细胞4102核中。除了配子外,体细胞中1653的基因基因组是二倍体,即有两个同源的基因组。2、真核细胞基因的转录产物为单顺反式。结构基因被转录并翻译成mRNA分子和多肽链。3、有重复,重复次数可以超过一百万次。4、在基因组中,非编码区多于编码区。5、大多数基因含有内含子,因此基因是不连续的。6、基因组比原核生物要大得多,原核生物有许多复制起点,每个复制子的长度都较小。扩展资料;倒位重复序列;这种重复序列即使在DNA浓度很低的情况下,也能很快地进行复性,因此也被称为零时间复性部分,约占人类基因组的5%。反向重复序列由同一序列的两个互补拷贝组成,在同一DNA链上反向排列。变性后复性时,同一链中的互补拷贝在链中形成碱基对,形成发夹或“+”结构。反转重复序列(即两个互补拷贝)可以有一到几个核苷酸间隔,也可以没有间隔。Palimdr-ome没有间隔,约占所有反向重复的三分之一。如果将两个互补拷贝组成的倒排重复单元作为一个单元,则倒排重复单元的长度约为300bp或稍短。两个单位之间的平均距离为1.6kb,两对反向重复单位之间的平均距离约为12KB,也就是说,它们大多分散在基因组中。。

组装完基因组重复基因好多 复杂基因组测序经典案例

三代测序(全基因组denovo),动植物基因组deovo测序基因Pacio单分子实时测序技术,对动植物基因组进行Pacio测序及拼接组装(纯三代组装),较好解决了传统测序组装技术难以。

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