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实时定量数据处理时对照组的基因相对表达量怎么计算? 看家基因的表达标准化

2020-07-23知识6

看家基因在进化中有什么作用? 看家2113基因,又名管家基因,5261持家基因。持家基因4102(house-keeping genes),又称管家基因,是指所有细胞中均要稳1653定表达的一类基因,其产物是对维持细胞基本生命活动所必需的。如微管蛋白基因、糖酵解酶系基因与核糖体蛋白基因等。管家基因是一类始终保持着低水平的甲基化并且一直处于活性转录状态的基因。植物的看家基因有哪些 从广义上讲,表达量较高且相对比较稳定的都可以称为看家基因。常见的actin,tublin,ubiquitin等家族的基因通常被用作基因表达的内参。看家基因作用是什么?实时荧光定量PCR技术中为什么要用它? 看家基因的意思是稳定表达的一种基因所以他的作用就是用来做内参比如在做PCR的时候,初始的模板量的不同直接导致扩增后的量的差别,那么看家基因的作用就出现了,要在看家基因的表达水平相同的情况下,比较其他基因的表达是否有升高或降低。双标准曲线是什么意思 所谓相对定量是指在测定目的基因的同时测定某一内源性管家基因,该管家基因的作用有(1)用于核苷酸的拷贝数的比较;(2)作为内源性对照补偿待测样本的体积变异、核酸抽提过程中造成的目的基因变异,以及反映反应体系内是否存在PCR扩增的影响因素;(3)标准化标本。由于管家基因在各种组织中是恒定表达的,所以可以以管家基因的定量来作为某种标准以比较样本来源不同的目的基因表达量的差异。通常选用的管家基因有GAPDH、β-actin、β2-微球蛋白和rRNA,研究者也可以根据具体的需要而选定合适的管家基因。使用的相对定量较为早期的方法是用一系列已知外参物做标准曲线,根据该标准曲线得到目的基因和管家基因的量,再将目的基因的同管家基因的比值作为定量的最后结果。这一方法要求外参、目的基因和管家基因的扩增效率一致。标准曲线方法使用标准 RNA 样品,标准曲线通过梯度稀释制备,用来对目的基因和看家基因进行分析,结果数据被用来生成标准曲线和线性方程。看家基因的标准曲线由其 C t 值对 RNA 的量做图(Figure 2A)。而目的基因的标准曲线由其 C t 值对任意的表达倍数做图。要计算未知样品的相对表达量,首先通过看家基因的标准曲线求出总 RNA 量。然后目的基因的 。看家基因GApDHmRNA引物是什么东西?有什么用?成分? 引物,作为DNA复制的起始点,在核酸合成反应时,作为每个多核苷酸链进行延伸的出发点而起作用的多核苷酸链。GAPDH的一个引物与感兴趣区域一端的一条DNA模板链互补,另一个引物与感兴趣区域另一端的另一条DNA模板链互补。可以有很多种,用软件可以设计一段基因的引物,再用PCR来扩增这段基因。GAPDH是甘油醛-3-磷酸脱氢酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase)的英文缩写。该酶是糖酵解反应中的一个酶。该基因是看家基因,几乎在所有组织中都高水平表达,在同种细胞或者组织中的蛋白质表达量一般是恒定的,且不受含有的部分识别位点、佛波脂等的诱导物质的影响而保持恒定,故被广泛用作realtime pcr,Western blot等实验操作的标准化的内参。看家基因是什么啊?(housekeepinggene)? 你翻译错了,专业来说应该是持家基因或者管家基因。它是指所有细胞中均要表达的一类基因,其产物是对维持细胞基本生命活动所必需的。如微管蛋白基因、糖酵解酶系基因与核糖体蛋白基因等。什么是半定量分析法? 半定量是RT-PCR做基因表达分析的一种方法,其操作的方法是在野生型和突变体中用一个看家基因(通常是actin)做参照标准来观察目标基因在各自的表达情况(上调还是下调),所谓半定量的“半”是通俗的说法,即在看电泳图估计参照亮度一致(可看作是表达的细胞数一致)情况下,确定目标基因的表达;这是与更加精确的Q-PCR的相对定量和绝对的量区分。

#基因合成#标准曲线

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