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做RT-PCR的时候为什么要设置标准反应体系和管家基因反应体系?还有就就是,为什么要制备用于绘制梯度稀释标准曲线的DNA模板?这些步骤在实验中有什么作用? rt pcr 看家基因

2021-03-05知识9

什么叫做半定性,什么叫做半定量 半定量是RT-PCR做基因表达分析的一种方法,其操作的方法是在野生型和突变体中用一个看家基因(通常是actin)做参照标准来观察目标基因在。

做RT-PCR的时候为什么要设置标准反应体系和管家基因反应体系?还有就就是,为什么要制备用于绘制梯度稀释标准曲线的DNA模板?这些步骤在实验中有什么作用? rt pcr 看家基因

半定量RT-PCR和定量RT-PCR的区别 半定量RT-PCR与定量RT-PCR的区别是半定量RT-PCR操作简便,可快速推测样品中特异mRNA的相对数量;而定量RT-PCB可实时定量,较半定RT-PCB更准确。半定量反转录-聚合酶链反应(semi-quantitative reverse transcription and polymerase Chain reaction,SqRT-PCR)是近年来常用的一种简捷、特异的定量RNA测定方法,通过mRNA反转录成cDNA,再进行PCR扩增,并测定PCR产物的数量,可以推测样品中特异mRNA的相对数量。定量RT-PCR(quantitative reverse transcription and polymerase Chain reaction,qRT-PCR)是在用一步法或两步法,在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。

RT-PCR的原理是什么?有何用途? 原理是:提取组织或细胞中的总RNA,以其中的mRNA作为模板,采用Oligo(dT)或随机引物利用逆转录酶反转录成cDNA。再以cDNA为模板进行PCR扩增,而获得目的基因或检测基因表达。该技术主要用于:分析基因的转录产物、获取目的基因、合成cDNA探针、构建RNA高效转录系统。RT-PCR(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction)即逆转录PCR,是将RNA的反转录(RT)和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术。首先经反转录酶的作用从RNA合成 cDNA,再以cDNA为模板,扩增合成目的片段。RT-PCR技术灵敏而且用途广泛,可用于检测细胞中基因表达水平,细胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cDNA序列。作为模板的RNA可以是总RNA、mRNA或体外转录的RNA产物。无论使用何种RNA,关键是确保RNA中无RNA酶和基因组 DNA的污染。用于反转录的引物可视实验的具体情况选择随机引物、Oligo dT 及基因特异性引物中的一种。对于短的不具有发卡结构的真核细胞mRNA,三种都可。扩展资料反转录酶的选择1、Money 鼠白血病病毒(MMLV)反转录酶:有强的聚合酶活性,RNA酶H活性相对较弱。最适作用温度为37℃。2、禽成髓细胞瘤病毒(AMV)反转录酶:有强的聚合酶活性和RNA酶H活性。最适。

real time PCR看家基因的选择重要吗

RT-PCR是,内参是什么时候加入,作用是什么?谢谢 你说的应该是realtimepcr吧,注意rt其实是逆转录reversetranscription的缩写,和realtime一定要分开来。常说的qpcr,qrt-pcr,都是通过实时(realtime)的方法,测定样品中某个模版的起始量ct值但是呢,由于之前rna提取、反转等步骤,各个步骤存在不同的效率,ct值并无法真实反应样品中模版的绝对量,因此,需要一个内参来做为参考。比方说,a基因的ct值,在a样品中是18,在b样品中是20,由于ab样品存在rna质量等等一系列不同,你无法直接就判断这个基因在a样品中的表达量是b样品的4倍。这时候,我们需要一个内参,假如内参ct值在a样品中是14,而在b样品中是15。由于内参的稳定性,在不同样品中被认为是表达量一致的,因此,a基因的在ab样品之间的-δδct值是1,也就是表达量为2倍的关系。这里,我们可以知道内参的作用,即通过测量内参,可以在后面分析过程中将不同样品的起始量均一化。内参需要选择在不同样品中有稳定表达量的基因,这就是为什么内参经常选择看家基因的原因。以小鼠为例,常用的内参有actingapdhhprt等等。当然,现在的很多观点认为这些基因在不同组织中丰度也不同,例如gapdh,在线粒体含量高的组织中丰度高,很多人认为用基因组dna做。

RT-PCR 看家基因(HGAPDH)循环数问题 RT-PCR看家基因(HGAPDH)循环数问题最近一直在做RT-PCR用的看家基因是HGAPDH。但做出来的CYCLENUMBER数值总是出现波动,有时候是14?

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