1948年1月17日，东北剿总司令部成立，卫立煌赴任东北担任东北行辕代主任兼剿总司令，负责全权指挥东北战事，算是一屁股坐上了这个火坑。
值得一提的是，东北军政长官此前曾不断变化过。最初为了接收东北，蒋介石任命熊式辉为东北行辕主任，杜聿明为东北保安司令，1946年6月之前杜聿明带着东北的国民党军一度占尽优势，将东北民主联军赶到了松花江以北，不过由于太过拘泥于一城一地的得失，后来国民党军机动兵团的优势兵力被牵制，至1947年开始，东北的国民党军不断的走下坡路，杜聿明也因为身体问题，不得不卸任赶赴北平治病。
第二任东北主政的人是陈诚，他主政期间将东北战局进一步带入到无底深渊，不得不说是我军的好帮手之一，陈诚以总参谋长的身份挤走了熊式辉以后，自任东北行辕主任，不仅如此还取消了此前东北保安司令部，将一切军政大权都拦在手中，总之陈诚在东北干的时间并不长，却起了相当坏的作用，至少在他离开之前，东北的国民党军已经逐渐被压缩，至1948年3月就只能固守长春、沈阳、锦州等有限的地盘。
卫立煌上任之初，面临的就是这样一种现况，当时东北解放区的面积占整个东北面积的97%，人口占86%，几乎已经占据了主动优势，可供卫立煌辗转腾挪的机会并不多，因此卫立煌一上任就命令各个城市的国民党军固守，无论各地守军如何求援，卫立煌都不派兵援助，避免在野战中被我军全歼，也因此和蒋介石产生严重分歧。
当时沈锦线已经为我军所切断，锦州成为一座孤城，蒋介石的想法，是想让卫立煌打通沈锦线，将东北的国民党军全部撤往锦州，可卫立煌不知道出于什么考虑，始终不同意该主张，由于一系列的分歧和摩擦，蒋介石后来干脆直接越级指挥，将卫立煌架空了，基本上后来抽掉沈阳各个部队建立廖耀湘兵团，也是蒋介石的主意，卫立煌是不赞同的。
直至后来锦州战役时，面对范汉杰的连续迭电求援，卫立煌则是不为所动，哪怕顾祝同带着蒋介石命令前往沈阳监督也无济于事，卫立煌甚至在召开军事会议期间和将领联名向上反应，认为沈阳机动兵力不足，只能坚守，顾祝同无奈，只好带着这个答复向南京蒋介石复命，蒋介石无奈，只能亲自赶赴沈阳指挥。
有人对卫立煌在东北一系列的指挥进行指摘，认为他有失名将的水准，甚至认为卫立煌有“通共”的嫌疑，毕竟抗战时期卫立煌与我军关系一度不错，不过也有人评价卫立煌的战略实际上可以挽救东北战局，毕竟依托于当时几个大城市的工业基础，卫立煌不仅可以做到自保，甚至还能牵制主东北百万我军主力。
时隔多年以后，任全国政协政史资料协会会员的杜聿明询问卫立煌夫人韩权华，对当年卫立煌在东北指挥问题却有不同的看法，她认为卫立煌在东北之所以不动，为的就是将蒋介石拖垮，毕竟当时国民党军在东北的主力，都是卫立煌在滇缅会战时期拉起来的精锐，不忍心见他们葬送在内战中，据说卫立煌还曾亲口和夫人说了一句：让蒋介石盲人瞎马，看他怎么走。
不过这些终究也只是猜测，至于卫立煌当年是怎么思量的，我们不得而知，不过可以肯定的是，卫立煌将军的行为是无愧于国家和民族的。
