甲状腺激素具有促进生长发育、产热、促进代谢等作用，是一种具有「正能量」的激素。若缺少「正能量」，体内其它营养物质的代谢都会「慢半拍」。
蛋白质不足
甲减时，胃肠道「效率」变慢，吸收蛋白质的速度也减慢，因此可能造成体内蛋白质不足。若缺少蛋白质，身体将出现消瘦、水肿、免疫力下降，影响心、肝、胃肠等器官的正常运转，未成年人的发育也因此变得迟缓。
骨质疏松
除了蛋白质吸收变慢外，此时钙质的吸收也减少，易造成骨质疏松、病理性骨折等。
维生素A缺乏
皮下胡萝卜素也因甲状腺素的缺乏，转化为维生素A的能力减弱。于是维生素A供不应求，由此造成夜盲或暗光中视物不清、眼结膜或角膜干燥、皮肤干燥脱屑、影响骨骼生长发育，以及消化道、呼吸道发生感染的机率增加。
体内胆固醇水平增高
甲减时，尽管胆固醇的合成减慢，但其代谢的速度将变得更慢，即胆固醇水平势必会升高。因此，甲减也成为血脂升高的「祸首」之一。
贫血
贫血可能由多种因素造成：一方面甲状腺素的缺乏，骨髓的造血功能受到抑制；另一方面，患者因食欲下降、胃酸分泌减低、某些抗体的产生导致造血原料铁、叶酸和维生素B12吸收减少。最终导致机体红细胞不足，引起不同程度的贫血，70%左右的甲减患者会发生贫血。
