大肠癌的病因和其他癌症一样，至今并未完全明了，以下几个因素可能与大肠癌的发病有关。
1、遗传因素
据估计约20%的大肠癌患者中，遗传因素可能起着重要的作用，而且这种家族遗传性在结肠癌比直肠癌更为常见。
2、饮食因素
一般认为高动物蛋白、高脂肪和低纤维饮食是大肠癌高发的因素，很显然，大肠癌是所谓的“富癌”，吃肉多，吃粗纤维食物少，大肠癌高发。
3、肠道疾病
另外，一些大肠非癌性疾患会增加大肠癌的发病，它们是大肠癌的癌前病变或癌前疾病。比如慢性溃疡性结肠炎、克罗恩病、息肉病、腺瘤等。据估计约有3%-5%的溃疡性结肠炎发生大肠癌，溃疡性结肠炎病史无20年，发生癌变约12.5%，30年时达40%左右。
另有相当部分的结肠癌起源于结肠多发性息肉，其癌前期病程约为5-20年左右。而家族性腺瘤性息肉病（FAP）患者25岁时恶变率近10%，到30岁时达50%，50岁以前几乎100%恶变。克罗恩病的癌变率一般认为比溃疡性结肠炎低一些，但远高于普通人群约4-20倍。
4、其他因素
最后还有一些其他因素也可能与大肠癌的发病相关。比如环境因素，缺钼，石棉长期接触，不良生活方式（久坐、缺乏体力活动、超重、肥胖等）。
