由于下巴变形，几乎不能吃东西。并且患有佝偻病、还时常会有幻觉，还有一个超大的头。不过他对此无能为力，也不能正常生育。西班牙的查理二世，世界上最大帝国之一的国王，却几乎不能说话或走路——这都是因为他的王朝是近亲繁殖。
皇室近亲繁殖导致的基因突变和出生缺陷，可能比已经估计的乱伦导致的基因突变更加糟糕。事实上，由于西班牙查理二世的近亲血统，导致了西班牙查理二世的死因：35岁时，他的头发都掉光了，并几乎不能走路。到了39岁他死时，因为没有继承人，导致欧洲陷入血腥的战争，各国都在争夺他的王位。
当然，西班牙的查尔斯二世是故意被近亲繁殖的。他的父亲娶了自己的侄女，这意味着查尔斯的母亲也是他的表亲，他的父亲也是他的叔叔。而这仅仅是个开始：西班牙哈普斯堡家族(habsburg)蓄意通婚超过200年，使他们成为历史上最奇怪的王室成员之一。
有了这些基因问题，我们很难不去想：西班牙查理二世到底长什么样？他那突出的哈布斯堡式下巴，使他几乎不可能吃东西，还经常流口水。他又矮又瘦，也很虚弱。但他的家人雇了艺术家，让世人觉得他强壮又健康。尽管如此，几个世纪以来近亲繁殖的结果，是无法隐藏的。查理是最后一个西班牙哈布斯堡王朝，虽然强大，但通过近亲繁殖结束了自己的历史。
查尔斯的两位曾祖父，一位娶了自己的侄女，另一位娶了他的堂姐。因为他的父母关系密切，查尔斯也是他母亲的第一个表兄和他父亲的曾甥。他的祖母也是他的姑妈。而查尔斯的家谱，可以追溯到一对单身夫妇：住在卡斯提尔的菲利普和乔安娜，他们生活在16世纪。
查尔斯可能患有两种遗传疾病：合并垂体激素缺乏和远端肾小管性酸中毒。第一个是由脑下垂体产生激素的基因突变引起的，是导致查尔斯身材矮小、不育和阳痿的原因。它还会导致肌肉无力和消化问题。
第二种是由基因突变引起的，使肾脏难以通过尿液排出酸。它会导致血尿，肌肉虚弱，头部相对于身体大小过大。
尽管画家们试图把查尔斯二世，描绘成一个健康、强壮的国王，并隐藏这位统治者身体状况的真相。随着年龄的增长，他的癫痫越来越严重，经常受到麻疹、风疹、口腔和支气管感染、频繁腹泻和呕吐等疾病的困扰。
他还有著名的哈布斯堡式下巴。突出的下巴使查尔斯几乎无法咀嚼食物。据英国使节亚历山大·斯坦霍普(Alexander Stanhope，查理二世)说，“他把吃的东西都吞了下去，因为他下颚太突出了，两排牙齿都长不齐。”
查尔斯结过两次婚，第一次是在18岁，第二次是在29岁，但两次都不能生育，其中一位妻子抱怨查尔斯阳痿。据了解，30多岁的查尔斯看上去像个老人。1698年，法国大使Marques d’harcourt在给路易十四的信中写道，查尔斯“脚、腿、腹部、脸肿胀，有时甚至舌头肿胀，使他不能说话”，“身体虚弱，一两个小时都不能下床”。
他与如此多的身体疾病作斗争，因此获得了“被蛊惑者”的称号，甚至在他死后，他这样的名声还在继续。皇室进行了尸检，这对大多数皇室来说并不常见，但查理二世是个例外。根据尸检，这位被施了魔法的国王“心脏很小，只有一粒胡椒那么大，肺部被腐蚀，肠子腐烂变质，肾脏里有三颗大石头，一个黑得像煤一样的睾丸，而他的脑袋里装满了水。”这样的结果可能被夸大了，但它证明了他在同时代人中的声望。
1661年查理二世出生时，他的父母一定认为他活不长了。当代著作称这个婴儿为“大脑袋”和“虚弱的母乳喂养婴儿”。查尔斯四岁时才会说话，八岁时才会走路。尽管许多绘画都试图把查尔斯描绘成一个健康的婴儿，但他从一出生就身体虚弱，身体不适。
查理四岁时父亲去世，于是他继承了西班牙王位。但即使是他自己的家人，也怀疑他是否能够独自统治——他的母亲成为了男孩的摄政王。历史学家斯坦利·g·佩恩(Stanley G. Payne)形容年轻的查尔斯是“可怜的王子”，是“西班牙哈布斯堡王朝五代近亲繁殖的堕落产物”。
17世纪对农民来说并不是一个好的时代。农业产量下降，饥荒摧毁社区，流行病席卷欧洲。但农民在另一个重要方面，仍然比西班牙哈普斯堡家族好：他们没有因为蓄意的近亲繁殖而尝尽苦果。
查尔斯的父亲，国王菲利普四世，在他10岁时，父母就把他的第一次婚姻，安排给了法国国王的女儿。在他们的八个孩子中，只有两个是男孩，而且都在继承王位之前就去世了。在第一任妻子去世后，菲利普与自己的侄女，奥地利的玛丽安娜再婚。这对夫妇有两个女儿和两个儿子，但儿子还是儿童的时候就去世了。
1527年到1661年，也就是查理二世出生的那一年，西班牙王室共生了34个孩子。其中近30%的人在1岁之前就去世了，有一半人在10岁之前去世。令人震惊的是，世界上最富有的家族之一的死亡率，比西班牙平民还要高，后者的婴儿死亡率约为20%。而这一切都是因为选择了在家族内部选择近亲来结婚。
近亲繁殖是欧洲皇室的普遍做法——这被称为皇室通婚。两个世纪以来，西班牙哈普斯堡家族通过与家族内部联姻，来维护王室遗产。在16和17世纪，他们绝大多数的婚姻都是与血亲之间。
哈布斯堡家族为他们的近亲繁殖辩护，声称这种做法加强了世系继承，帮助巩固了政治联盟。为了确保血统纯正而实行的通婚，带来了大量的遗传疾病和畸形，并最终摧毁了君主制。
查理继承了一个可以追溯到16世纪的庞大帝国，当时他的祖先查理五世统治过德国、奥地利、荷兰、西班牙和新大陆的大片领土。他辽阔的疆域被描述为“太阳永不落的帝国”。
财富通过西班牙的主要港口城市塞维利亚涌入西班牙，塞万提斯把塞维利亚描述为“一个寻找冒险的地方，因为在每一条街道和每一个街角，都有比其他任何地方都多的冒险。”西班牙的横渡大西洋的船队，每年两次出现在美国，船上载有黄金和白银以及可可、菠萝和辣椒等外国奢侈品。但所有西班牙帝国的财富，都无法阻止哈布斯堡王朝的衰落。
西班牙在17世纪经历了长期的衰退。在1580年到1630年间，数百万磅的白银涌入西班牙，然后大量的白银流入欧洲市场，造成了西班牙货币的极度通货膨胀。君主制承担了巨额债务，同时为欧洲和美洲的战争，提供了大量资金。
但哈普斯堡家族领导不力，也是导致人数下降的原因之一。历史学家J.H. Elliot在他的著作《西班牙帝国》(Imperial Spain)中，这样描述查尔斯二世(Charles II)的统治：“这个衰落王朝最后一个遗迹，被留下来管理着一个支离破碎的君主政体，而它本身，也不再是伟大帝国”国王根本无法统治他的帝国，帝国再也无法达到16世纪的巅峰。
很明显，查理活不长了，而且没有自己的孩子。1700年，查理颁布了他的遗嘱。在文件中，查尔斯选择了菲利普，安茹公爵，作为他的继承人。菲利普是查尔斯妹妹的孙子，她嫁给了法国路易十四。但查尔斯的死并没有带来平稳的继承，反而引发了多年的战争。
查理是西班牙哈布斯堡家族的最后一个成员，由于西班牙帝国的富裕，许多其他欧洲强国都想夺取王位。在查尔斯死之前，英国人，荷兰人和法国人就已经在讨论如何瓜分他的帝国了。
西班牙王位继承战争，从1701年一直持续到1713年，当时强大的法国君主路易十四，为了让他的孙子登上王位，与英国、荷兰和神圣罗马帝国的联盟作战。这场战争夺去了一百多万人的生命，最后，一位法国波旁王朝的君主，登上了西班牙的王位。
