清军入关直入北京，推翻明朝建立清朝，这里面很大的原因来至于明朝内部的原因，清军入关其实没有受到多大阻力，当时明朝地方手握重兵的将帅没有来主动征讨清军。有的军队还助清平李自成农民军和明朝的反抗军，清朝还封了云南的吴三桂、广东的尚可喜、福建的耿精忠为藩王。清朝占领明朝后台湾一直就是一块心病。这时台湾的郑成功也一直关注形式伺机而动。
从清朝建立一直到康熙十二年，年幼的康熙做出要撤藩决定。当年11月三番之乱开始。在台湾这边郑成功已传位给他儿子郑经，这个郑经不是一个正经人，在三番没有乱的时候，就动过邪念，动过歪脑筋，他给康熙上过一个奏折，要求清朝仿照高丽和日本，向清朝称臣纳贡，以藩属的关系存在。
这样可以年年纳贡，岁岁称臣。在一般的皇帝看来是一件挺好的事，但是康熙拒绝了，拒绝的理由是，台湾一直是中国的领土，任何人都不可以以任何理由把台湾分割占领。因为当时郑家带过的士兵，还有台湾很多人都是从大陆过去的，所以他们的家都在大陆。
三番一乱以后康熙有点应接不暇，因为这三个人都是挺能打仗的，这个时候郑经要带来郑氏家族以及部下反攻大陆。康熙抓住三番之命脉，主攻吴三桂，历时8年三番平定。郑经反攻大陆计划才刚开始就失败，失败后郑经心里极度失落，脸色看谁都不好看，一怒之下我死给你看，死后就把位置传给了大儿子郑克臧,，就鹿鼎记中被韦小宝折腾够呛那位，郑克臧那就是一位顽固子弟。
当年郑家准备要在台湾独立的是康熙就启用了以前郑成功手下一员大将，被提升为水师提督，这就是施琅。施琅最早是跟随郑成功的父亲郑芝龙都归顺清朝，由于当时清朝刚刚得天下，没有的到很好安排，又跟郑成功抗清复明了，一次施琅得罪郑成功，郑成功就把施琅家人给杀了，父亲兄弟都杀了。为报了报仇投降清朝。康熙二十二年施琅带领水师先行在澎湖海战对台湾水师获得大胜。后守台湾因功授靖海将军，封靖海侯。
