ZKX's LAB

网上的生物信息学资源都有哪些? ucsc基因组蛋白修饰可视化

2020-10-10知识31

refseq和ucsc人类基因组注释文件哪个质量更高UCSC Genome Browser是由University of California Santa Cruz(UCSC)创立和维护的,该站点包含有人类、小鼠和大鼠等多个物种的基因组草图,并提供一系列的网页分析工具。站点用户可以通过它可靠和迅速地浏览基因组的任何一部分,并且同时可以得到与该部分有关的基因组注释信息,如已知基因,预测基因,表达序列标签,信使RNA,CpG岛,克隆组装间隙和重叠,染色体带型,小鼠同源性等。用户也可以因为教育或科研目的加上他们自己的注释信息。UCSC Genome Browser目前应用相当广泛,比如Ensembl 就是使用它的人类基因组序列草图为基础的。

网上的生物信息学资源都有哪些? ucsc基因组蛋白修饰可视化

UCSC基因组上染色体图怎么看 最顶上显示该基因在染色体的位置(红竖线表示)接下来的是该基因的图谱,黑块代表外显子,线条代表内含子。。下面的部分是其他物种的同源序列。再下面的箭头可以左右移动中点。

网上的生物信息学资源都有哪些? ucsc基因组蛋白修饰可视化

已知一段基因序列,怎么知道有什么蛋白质结合到其DNA上? 除了用ChIP或streptavidin biotin-label DNA pull dowm,还有什么好方法么?

网上的生物信息学资源都有哪些? ucsc基因组蛋白修饰可视化

#dna序列#基因组注释#科学#基因组

随机阅读

qrcode
访问手机版