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基因组中重复序列识别与分析 植物基因组有大量的重复序列,重复序列正确识别和组装需要开发特殊的计算机软件。我国科学家成功研

2020-10-09知识13

什么是分子遗传标记?常见的分子遗传标记有哪些?

基因组中重复序列识别与分析 植物基因组有大量的重复序列,重复序列正确识别和组装需要开发特殊的计算机软件。我国科学家成功研

全基因组测序数据获取后应该怎么分析? MutationTaster(http://www. mutationtaster.org/。第三个是个数据集,dbNSFP(https:// sites.google.com/site/j popgen/dbNSFP),为人类非同义单核苷酸变体(nsSNV)和剪接。

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真核基因组的高度重复序列 a.参与复制水平的调节反向序列常存在于DNA复制起点区的附近。另外,许多反向重复序列是一些蛋白质(包括酶)和DNA的结合位点。b.参与基因表达的调控DNA的重复顺序可以转录到核内不均一RNA分子中,而有些反向重复顺序可以形成发夹结构,这对稳定RNA分子,免遭分解有重要作用.c.参与转位作用几乎所有转位因子的末端都包括反向重复顺序,长度由几个bp到1400bp。由于这种顺序可以形成回文结构,因此在转位作用中即能连接非同源的基因,又可以被参与转位的特异酶所识别。d.与进化有关不同种属的高度重复顺序的核苷酸序列不同,具有种属特异性,但相近种属又有相似性。如人的α卫星DNA长度仅差1个碱基(前者为171bp,后者为172bp),而且碱基序列有65%是相同的,这表明它们来自共同的祖先。在进化中某些特殊区段保守的,而其他区域的碱基序列则累积着变化。e.同一种属中不同个体的高度重复顺序的重复次数不一样,这可以作为每一个体的特征,即DNA指纹f.α卫星DNA成簇的分布在染色体着丝粒附近,可能与染色体减数分裂时染色体配对有关,即同源染色体之间的联会可能依赖于具有染色体专一性的特定卫星DNA顺序。

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4. 人类基因组中存在着重复单位为2~6bp的重复序列,称为: 微卫星2113DNA微卫星DNA:重复单位序列5261最短,只有2~6bp,串联成簇,长度50~100bp,又4102称为短串联重1653复序列(Short Tandem Repeat STR)。广泛分布于基因组中。其中富含A-T碱基对,是在研究DNA多态性标记过程中发现的。1981年Miesfeld等首次发现微卫星DNA,其重复单位长度一般为1~6个核苷酸,双核苷酸重复单位常为(CA)n和(TG)n。

全基因合成钱对目的基因序列进行GC含量和重复序列分析的软件是什么? 生物信息学各个领域中的软件数目庞大,在EBI 1997年的分子生物学程序目录中就收录了530多种常用软件。序列比对和数据库搜索软件有BLAST,FASTA,BLITZ等;。

植物基因组有大量的重复序列,重复序列正确识别和组装需要开发特殊的计算机软件。我国科学家成功研 正确答案:B

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