根据你的问题，你做林木的遗传多样性分析应该是一种或者近缘种的分析吧。（1）DNA标记方法中，现在最有效的是用微卫星标记（如SSR标记），但是微卫星有时候不好扩增，可能需要较长的摸索时间；因此RFLP和AFLP等老方法也可以一用，优点是速度快。（2）对于遗传多样性分析来说，等位酶分析更好。同工酶是功能相同的一类蛋白质，但是它们的编码基因不同，因此并不能很好的反应同种不同种群或近缘种间的遗传多样性关系；等位酶是由同一个基因的不同等位基因编码的，有进化上的关系，更适合用于遗传多样性分析。（3）蛋白质水平上，可以用凝胶电泳技术检验蛋白质条带的多态性（这是也比较常用的）；也可以直接蛋白质测序，但是这个成本高，并且有些蛋白测序难度大。
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微生物多样性分析中常见的β多样性分析有哪些
微生物群落多样性测序与功能分析 详细关于主成分分析的解释推荐大家看一篇文章，http：//blog.csdn.net/aywhehe/article/details/5736659。通过PCA 可以观察个体或群体间的差异。每一个点代表一个样本，相同。
PCR怎么检测遗传的多样性 遗传多样性可以通过检测基因多态性来获得信息。检测基因多态性的方法有很多，包括你所说的PCR方法。以下是介绍。如果有这方面的实验需求的话，可以到我们百替生物来看看哦。我们专业提供生物医学技术服务！1．限制性片段长度多态性（Restriction Fragment Length Polymorphism，RFLP）：由DNA 的多态性，致使DNA 分子的限制酶切位点及数目发生改变，用限制酶切割基因组时，所产生的片段数目和每个片段的长度就不同，即所谓的限制性片段长度多态性，导致限制片段长度发生改变的酶切位点，又称为多态性位点。最早是用Southern Blot/RFLP方法检测，后来采用聚合酶链反应（PCR）与限制酶酶切相结合的方法。现在多采用PCR-RFLP法进行研究基因的限制性片段长度多态性。2．单链构象多态性（SSCP）：是一种基于单链DNA构象差别的点突变检测方法。相同长度的单链DNA如果顺序不同，甚至单个碱基不同，就会形成不同的构象。在电泳时泳动的速度不同。将PCR产物经变性后，进行单链DNA凝胶电泳时，靶DNA中若发生单个碱基替换等改变时，就会出现泳动变位（mobility shift），多用于鉴定是否存在突变及诊断未知突变。3．PCR-ASO探针法（PCR-allele specific oligonucleotide，ASO）：即等位基因。
遗传分析模型软件 （1）DNA标记方法中，现在最有效的是用微卫星标记（如SSR标记），但是微卫星有时候不好扩增，可能需要较长的摸索时间；因此RFLP和AFLP等老方法也可以一用，优点是速度快。（2）对于遗传多样性分析来说，等位酶分析更好。同工酶是功能相同的一类蛋白质，但是它们的编码基因不同，因此并不能很好的反应同种不同种群或近缘种间的遗传多样性关系；等位酶是由同一个基因的不同等位基因编码的，有进化上的关系，更适合用于遗传多样性分析。（3）蛋白质水平上，可以用凝胶电泳技术检验蛋白质条带的多态性（这是也比较常用的）；也可以直接蛋白质测序，但是这个成本高，并且有些蛋白测序难度大。
遗传多样性只表现在dna分子水平吗 表现层次 由于遗传信息储存在染色体和细胞器基因组的 DNA 序列中 故严格地说来 遗传多样 性都起因于 DNA 分子水平 但这并不意味着遗传多样性只表现在 DNA 分子水平 遗传学中 心法则为 转录 转译 DNA mRNA 蛋白质 酶 细胞 组织 器官 个体 遗传信息通过转录和转译过程决定了多肽链中的氨基酸顺序 由多肽链构成的蛋白质进 一步形成细胞和组织 或在生物体内执行不同的功能 引起一系列错综复杂的代谢变化 最 后表现出各种各样的形态特征和生理性状 由于大部分分子水平的变异会通过上述过程影响 到转译后的各个层次或水平上 故遗传多样性同样可以在细胞 器官 生理代谢以及形态学 水平上表现出来 形态学水平上的变异是最易观察和引起人们注意的一种表型变异 例如 人类群体在脸 部特征 皮肤色素 身体外形 身高 体重等方面都表现出差异 形态学变异也是最早被科 学家们进行研究以及被人类加以利用的多样性 例如 亚洲瓢虫 Harmonia axyridis 鞘翅 变异就是很典型的例子 该种出现在西伯利亚 中国 朝鲜和日本 鞘翅几乎全黑的表型在 西伯利亚中西部占优势 若往东则黄底黑斑的表型频率逐渐增加 而在远东地区则发现大量 的黑底红斑个体 此外对蜗牛 蝴蝶 蝗虫和鸟类等类群的类似研究也。
