生物信息学中的连锁分析与关联分析有哪些区别和联系？ 文献综述部分，不是生信专业的，看看对你有没有用处吧—…
基因连锁分析的介绍 基因定位的连锁分析是根据基因在染色体上呈直线排列，不同基因相互连锁成连锁群的原理，即应用被定位的基因与同一染色体上另一基因或遗传标记相连锁的特点进行定位。生殖细胞在减数分裂时发生交换，一对同源染色体上存在着两个相邻的基因座位，距离较远，发生交换的机会较多，则出现基因重组；若两者较近，重组机会较少。重组DNA和分子克隆技术的出现，发现了许多遗传标记—多态位点，利用某个拟定位的基因是否与某个遗传存在连锁关系，以及连锁的紧密程度就能将该基因定位到染色体的一定部位，使经典连锁方法获得新的广阔用途，成为人类基因定位的重要手段。
连锁基因图谱单位是什么？ 遗传图谱：某一物种的染色体图谱（也就是我们所知的连锁图谱），显示所知的基因和/或遗传标记的相对位置，而不是在每条染色体上特殊的物理位置。采用遗传学分析方法将基因或其它DNA标记按一定的顺序排列在染色体上，这一方法包括杂交实验，家系分析。标记间的距离（遗传图距）用减数分裂中的交换频率来表示，单位为厘摩Centi-Morgan，cM)，每单位厘摩定义为1%交换率。遗传学图谱的解像度（分辨率）低，大约只能达到100万碱基对(1Mb)的水平。物理图谱：顾名思义，是DNA中一些可识别的界标（如限制性酶切位点、基因等）在DNA上的物理位置，图距是物理长度单位，如染色体的带区、核苷酸对的数量等 两者异同：①遗传图谱是基于重组频率，物理图谱是基于直接测量的DNA结构。②减数分裂重组的频率并不统一沿大多数染色体。有一些热点和冷点在重组和/或突变。热点和冷点会导致相当大的格律失真时，遗传图谱和物理地图并排排列时。③遗传图谱表示的是基因或标记间的相对距离，以重组值表示，单位CM ④物理图谱表示的是基因或标记间的物理距离，距离的单位为长度单位，如μm或者碱基对数（bp或kp）等。简而言之前者是描述的基因相对位置，后者是具体的碱基位置 二者存在的意义：通过遗传。
遗传学二倍体植株，其A/a、B/b、D/d三个基因位点连锁关系如下a 20 b 50 d 现有一基因组成为Abd/aBD的植株 二倍体植株，其A/a、B/b、D/d三个基因位点连锁关系如下：a 20 b 。
交换值，连锁强度和基因之间距离三者的关系 交换值(crossing over value)：两对基因之间发生交换的概率。l重组率(recombination frequency，RF)，它是指杂合体产生重组型 配子 数占总配子数的百分率。。
什么是基因，基因和性状之间的关系 经典遗传学基因的概念：2113（1）基因位于染色5261体上，是染色体的一个位点4102.（2）基因是不连续的颗1653粒状因子.（3）基因是突变和重组的最小单位.（4）基因是一个功能单位，它控制正在发育有机体的某一个或某些性状，如白花、红花等.因此，经典遗传学认为基因是一个最小的单位，不能分割，既是结构单位（突变和重组），又是功能单位（控制性状）.分子遗传学基因的概念：（1）基因在染色体上，一个基因相当于携带有特定的遗传信息一段DNA分子.（2）基因由众多碱基对构成，一个碱基对为基因的一个位点.（3）突变子：基因是性状突变时产生突变的最小单位.一个突变子可以小到只有一个碱基对；（4）重组子：是性状重组时可交换的最小单位.一个交换子可以只包含一个碱基对；（5）顺反子：表示一个起作用的单位，可转录一条完整的RNA分子，或编码一条多肽链.（6）另外基因应包含不仅是编码蛋白质肽链或RNA的核酸序列，还包括为保证转录所必需的调控序列、5′非翻译序列、内含子以及3′非翻译序列等所有的核酸序列（蛋白质基因和RNA基因）总之，基因是DNA分子上带有遗传信息的特定核苷酸序列区段，并且在染色体上位置固定，序列连续，遗传信息就存在于核苷酸(碱基)序列中.
