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expasy抗原决定簇预测 “抗体选择指南”是什么呢?

2020-10-02知识9

“抗体选择指南”是什么呢? 检测任何目的靶蛋白都有不止一种抗体可供选择,为缩小抗体的选择范围选中合适的抗体,需要考虑如下几种因素:?分析试验应用的类型?样本蛋白的结构性质?。

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怎么鉴别一个蛋白质是不是酶? 酶是具有生物催化活性的蛋白质,甚至是特殊的RNA。所以在今天的生物学中,蛋白质不一定是酶,酶也不一定是蛋白质。那么怎么鉴别你分离纯化的蛋白质是一种酶呢?首先,我们需要把分离纯化的蛋白质进行蛋白质测序,获得该蛋白质的氨基酸序列。然后,通过生物信息学网站分析该蛋白的性质和结构,从而预测功能,看是否具有酶的活性结合域或变构域,是否具有辅因子结合位点。先用NCBI中的BLAST比对分析蛋白序列的相似性,看是否有相似度较高的已知酶蛋白序列,再结合Motif数据库中的PROSITE分析,分析样品蛋白是否具有酶活性位点、辅因子结合位点、变构域、二硫键等结构,该库可以辅助分析,样品蛋白是否属于已知的某种酶家族。此外,还可以结合ExPASy中的SWISS-PROT进行蛋白晶体结构建模分析,能够更加直观地看出样品蛋白的整体结构及功能域,后期再结合酶活反应实验加以验证。如果在NCBI数据库种比对不到任何高相似度的已知酶蛋白序列,也不能完全排除样品蛋白不是酶,但此时,我们就需要先分析该样品蛋白所在细胞内的各种化合物,常识用这些化合物作为底物与样品蛋白进行酶活反应,看是否有新化合物的生成,当然,有的还需要添加辅助因子,无论是试细胞内的这些化合物,还是摸索。

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免疫学实验一抗,二抗的选择与搭配原则和方法 最低0.27元开通文库会员,查看完整内容>;原发布者:重庆无敌小牛牛一抗2113、二抗的选择一抗的选择?1.分析实验应用5261类型?WB(WesternBlot免疫印迹)?IHC(immunohistochemistry免疫组织化学4102)?ELISA(enzyme-linkedimmunoadsordentassay酶联免疫吸附试验)?2.样本蛋白1653的结构性质?样本蛋白的结构域全长蛋白、蛋白片段、多肽、细菌、细胞蛋白片断或一种特殊的同型物或蛋白全长的某一区域用FACS流式检测活细胞的表面蛋白?样本的提取和处理过程某些抗体要求样本经过某些特殊处理,例如:许多抗体只识别还原和变性的、表位已暴露不受二级四级结构阻碍的蛋白样本,某些抗体仅识别天然折叠状态的蛋白。当选择免疫组化的抗体时,应注意某些抗体只识别未固定的冷冻的组织,另一些抗体则适用于无需抗原修复解交联步聚的甲醛固定石蜡包埋的组织,用含此片段域的免疫原制备出的抗体。用含该表面蛋白的胞外域来免疫制备的抗体。3.样本的物种选择物种相同或有交叉反应的抗体,抗体可能与不同物种的同种靶蛋白有交叉反应,因其氨基酸序列同源性较高,如果样本的种类未列入抗体说明书上的交叉反应种属表中,并不意味着该抗体不适用于检测该物种的蛋白,而只是表示该物种尚未。

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#一抗二抗#免疫学#科普#抗体

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