在清朝统一全国时，有一个地方让清朝难以啃下，耗时之长，经过康熙、雍正、乾隆三代帝王，最终才完成全国大统一，这就是西域强国：准噶尔汗国。从1644年，清朝入关，开始进行统一天下的战争，1658年，吴三桂攻入云南，1662年，永历帝被杀，南明结束，1683年，清朝攻克台湾，明郑结束，经过20多年，基本统一了大陆。从1717年~1727年，又经过多次战争，其中战争有清平定西藏之战、清平定青海之战、布尔哈屯之战等，最终清朝统一了青藏高原，1727年，清朝设置驻藏大臣，标志着西藏进入清朝的统治内。此时还剩下西域，西域的强国准噶尔汗国，还时常骚扰清朝。从康熙年间开始，国力处于上升期的准噶尔，到处扩张。
我们常说清朝平定准噶尔汗国，其实也正确，也不正确。首先准噶尔汗国她不是清朝内部的叛乱，而是卫拉特蒙古的准噶尔部建立起来的国家。在西域和清朝也没有太多的关系来往，但在1635年时，卫拉特盟主固始汗归顺后金（清朝），1646年，卫拉特各部首领全部归顺清朝，因此，说准噶尔对抗清朝也是一种叛乱。到1676年，葛尔丹打败卫拉特盟主鄂齐尔图汗，建立了一个专制的汗国，国力逐渐上升。1688年，噶尔丹越过蒙古中的杭爱山，入侵喀尔喀蒙古，喀尔喀蒙古被迫南迁，1690年，噶尔丹又入侵漠北的喀尔喀蒙古，喀尔喀蒙古是归顺于清朝的。噶尔丹不断的入侵喀尔喀蒙古，惊动了清朝的康熙帝，康熙命令两路大军远征，从此统一准噶尔汗国战争爆发。
从1690年开始，到1758年结束，近七十年的风雨，清朝走过了哪些惨痛的教训呢？清朝在征战准噶尔时，也遭到了惨痛的失败，在康熙三征准噶尔前，一支两万人的军队在对抗准噶尔军时，结果是全军覆没。因此清朝统一准噶尔，并没有想象中那么顺利，而且，对领土渴望的沙俄会放过准噶尔汗国吗？他们也想吞并准噶尔汗国，只是实力不允许，导致沙俄只能暂时放弃。这么多年才完成统一西域，清朝面临哪些困难？为什么会这么难？原因有三点：第一：地理位置的优势，首先，身处西域的准噶尔汗国，有着自身的优势。清军对这些地方都是比较陌生的，熟悉程度不够，军事能力遭到一定的限制，受制于地理位置的限制，清军容易中埋伏，或者半天找不到敌人，军事行动越拖越久，军队士气就会被耗尽，战斗力会下降。而且，战线拉的太长，对清朝输送的军粮也是一大问题，容易遭到袭击。
西域的气候，同样是清军的一大考验，地处内陆的西域，昼夜温差大，来自中原的清军，并没有像准噶尔汗国军队那样，完全适应这种问题。而且西域戈壁和沙漠又多，绿洲的分布又是必须要了解和掌握的。却少水，一场战争下来，就会面临被灭的威胁，更可怕的是还要面临沙尘暴的威胁，塔克拉玛干沙漠的沙尘暴，足于让一支军队全军覆没，可见，征服准噶尔，并没有想象中那么容易。第二：准噶尔汗国的实力。不可否认的是，准噶尔汗国是一个强大的国家，极盛时期，领土达到了四百多万平方公里，称霸中亚的存在。曾经沙俄多次的入侵，都被准噶尔汗国击败，逼迫沙俄承认准噶尔汗国的地位。吃过亏的沙俄，知道准噶尔汗国比较强大，一下子无法吃掉，就暂时放弃了入侵的思想。
准噶尔汗国还在国内进行一系列的改革，首先是文字，把蒙文改成“托沁”文字，成为准噶尔的统一文字。作为游牧民族，春秋在狩猎，锻炼骑射能力，夏冬又进行军事训练，基本常年都在锻炼，谁敢说这样的军队不会强大？只有他们自身内乱或者遇到昏君，才会拖垮自身，而之后的事实证明，准噶尔内乱，让乾隆皇帝有了机会歼灭准噶尔汗国的机会。第三：沙俄的支持，沙俄入侵不成，反而支持准噶尔汗国入侵清朝，这种强盗的思想，是沙俄常用的做法。他们给准噶尔汗国提供许多武器装备，而沙俄不亡清朝是不会甘心的，等到准噶尔和清朝两败俱伤的时候，才是他出手的最好时机。如果清朝无法战胜准噶尔，被拖垮之后，对中华民族来说是灾难的，沙俄不会放过这种机会，一举灭掉清朝，这样就获得了他想要的出海口。
好在康熙、雍正、乾隆三位帝王能力还是很强的，又不是昏君，这才统一了新疆，为清朝增加了四百多万平方公里的领土。新疆的统一战争，是反对民族分裂的行为，更是打击沙俄入侵新疆的幻想，是巩固民族团结的又一大胜利。没有新疆的存在，中国的版图是不完整的。从这些都可以看出，清朝统一准噶尔，对中国来说太重要了，西域已经从中原王朝脱离了近千年，从一个信仰佛教的西域，如今变成一个伊斯兰化的西域。这期间经历了太多太多的故事，而这千年的转机，造成了西域的回归，奠定中华民族大统一的王朝时代，如果拖到近代史，新疆更没有收回的可能。
